RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636350.1

CACNB4-222, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 7,654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-222	ENST00000636350	CLCN1	P35523	988 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CACNB4-222	ENST00000636350	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	NUCB2	P80303	420 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	MBD3	O95983	291 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	NES	P48681	1621 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SNX21	Q969T3	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ITGAE	P38570	1179 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	NRDC	O43847	1150 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	CAVIN2	O95810	425 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ADAMTS12	P58397	1594 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ARID3A	Q99856	593 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	MYOM2	P54296	1465 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	MCC	P23508	829 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SYCP1	Q15431	976 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	NUP155	O75694	1391 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	CCP110	O43303	1012 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	PKD2	Q13563	968 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	RABEP1	Q15276	862 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SYNM	O15061	1565 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	PZP	P20742	1482 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	TUBB4B	P68371	445 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	NEMF	O60524	1076 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ZFYVE9	O95405	1425 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	HMMR	O75330	724 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	FANCA	O15360	1455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CACNB4-222	ENST00000636350	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CACNB4-222	ENST00000636350	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CACNB4-222	ENST00000636350	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CACNB4-222	ENST00000636350	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
CACNB4-222	ENST00000636350	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.09	□□□□□ -1.76
CACNB4-222	ENST00000636350	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CACNB4-222	ENST00000636350	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CACNB4-222	ENST00000636350	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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