RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627542.2

PCBP1-AS1-318, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 702 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa13.4□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.4□□□□□ -0.26
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 LTKP29376 864 aa13.39□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.38□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.37□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FOXD1Q16676 465 aa13.37□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DIP2AQ14689 1571 aa13.36□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PPLO60437 1756 aa13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.35□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CPS1P31327 1500 aa13.34□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.34□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 IFT172Q9UG01 1749 aa13.33□□□□□ -0.27
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.33□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 STAC3Q96MF2 364 aa13.33□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PIK3R4Q99570 1358 aa13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TBX22Q9Y458 520 aa13.32□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 BCANQ96GW7 911 aa13.31□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CERKQ8TCT0 537 aa13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MYOM2P54296 1465 aa13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NWD1Q149M9 1564 aa13.28□□□□□ -0.28
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KCNA6P17658 529 aa13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RGL3Q3MIN7 710 aa13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.26□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 LAMC1P11047 1609 aa13.25□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PCGF6Q9BYE7 350 aa13.25□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.24□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ALKQ9UM73 1620 aa13.23□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PIK3C2GO75747 1445 aa13.22□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.22□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.22□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.21□□□□□ -0.29
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.21□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.2□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.19□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FBXO41Q8TF61 875 aa13.19□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 METP08581 1390 aa13.18□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PTCH1Q13635 1447 aa13.17□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 PTPRUQ92729 1446 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TOM1O60784 492 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TMEM94Q12767 1356 aa13.16□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TECPR2O15040 1411 aa13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SIRT1Q96EB6 747 aa13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 MSH6P52701 1360 aa13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ABCC11Q96J66 1382 aa13.14□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NEUROD1Q13562 356 aa13.13□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TONSLQ96HA7 1378 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 L3MBTL2Q969R5 705 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DCCP43146 1447 aa13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ADGRB1O14514 1584 aa13.11□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 DLC1Q96QB1 1528 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 C14orf37Q86TY3 774 aa13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.09□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa13.09□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.08□□□□□ -0.31
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.08□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ATF3P18847 181 aa13.07□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 NALCNQ8IZF0 1738 aa13.07□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 STK26Q9P289 416 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa13.05□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 SLAIN2Q9P270 581 aa13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 POGKQ9P215 609 aa13.02□□□□□ -0.33
PCBP1-AS1-318ENST00000627542 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.2 ms