RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623103.1

C9orf62-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 62, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf62, Length 1,924 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62-201ENST00000623103 MYT1Q01538 1121 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf62-201ENST00000623103 MROH2AA6NES4 1674 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf62-201ENST00000623103 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf62-201ENST00000623103 TMF1P82094 1093 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 TESK2Q96S53 571 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 MYOM2P54296 1465 aa23.18■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 RALBP1Q15311 655 aa23.18■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.15■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 TMC1Q8TDI8 760 aa23.14■■□□□ 1.3
C9orf62-201ENST00000623103 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 ADGRB3O60242 1522 aa23.12■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 GGT6Q6P531 493 aa23.12■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 ABCC3O15438 1527 aa23.12■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 NPATQ14207 1427 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 PPLO60437 1756 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.08■■□□□ 1.29
C9orf62-201ENST00000623103 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 SYNMO15061 1565 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 MLECQ14165 292 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 CDCA8Q53HL2 280 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 NLRP13Q86W25 1043 aa23.04■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 PANK3Q9H999 370 aa23.03■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 MYOM1P52179 1685 aa23.02■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.02■■□□□ 1.28
C9orf62-201ENST00000623103 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 PIK3C2BO00750 1634 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 NOS1P29475 1434 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 SLC24A1O60721 1099 aa23■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.99■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.99■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
C9orf62-201ENST00000623103 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 NUDCQ9Y266 331 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 PIK3C2GO75747 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 ZMYM3Q14202 1370 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 C3P01024 1663 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 ERVK-7P63135 1459 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf62-201ENST00000623103 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.87■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.87■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 ADGRB1O14514 1584 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 PTPRMP28827 1452 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 INSRP06213 1382 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf62-201ENST00000623103 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.82■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.8■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.78■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 PDE3BQ13370 1112 aa22.78■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.78■■□□□ 1.24
C9orf62-201ENST00000623103 PPP2R1AP30153 589 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf62-201ENST00000623103 IDI1Q13907 227 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf62-201ENST00000623103 ZFYVE9O95405 1425 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf62-201ENST00000623103 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.73■■□□□ 1.23
C9orf62-201ENST00000623103 TNRQ92752 1358 aa22.73■■□□□ 1.23
C9orf62-201ENST00000623103 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf62-201ENST00000623103 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
C9orf62-201ENST00000623103 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
C9orf62-201ENST00000623103 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
C9orf62-201ENST00000623103 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
C9orf62-201ENST00000623103 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf62-201ENST00000623103 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.69■■□□□ 1.22
C9orf62-201ENST00000623103 USP32Q8NFA0 1604 aa22.68■■□□□ 1.22
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