RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619252.4

CU633967.1-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU633967.1, Length 549 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-201ENST00000619252 E9PCH4 1651 aa15.24■□□□□ 0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.23■□□□□ 0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 ZFYVE9O95405 1425 aa15.23■□□□□ 0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 TMEM94Q12767 1356 aa15.23■□□□□ 0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 ROCK1Q13464 1354 aa15.23■□□□□ 0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 KCNA6P17658 529 aa15.22■□□□□ 0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 FAM135BQ49AJ0 1406 aa15.22■□□□□ 0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 DIP2AQ14689 1571 aa15.22■□□□□ 0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa15.21■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.19■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.18■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 MSH6P52701 1360 aa15.18■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.17■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 ITGAEP38570 1179 aa15.16■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 BCANQ96GW7 911 aa15.16■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 PHLPP1O60346 1717 aa15.16■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.14■□□□□ 0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 TRPM2O94759 1503 aa15.13■□□□□ 0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 PIK3R4Q99570 1358 aa15.12■□□□□ 0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 TBX22Q9Y458 520 aa15.1■□□□□ 0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 NUP155O75694 1391 aa15.1■□□□□ 0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.09■□□□□ 0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.08■□□□□ 0
CU633967.1-201ENST00000619252 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CU633967.1-201ENST00000619252 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CU633967.1-201ENST00000619252 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.06■□□□□ 0
CU633967.1-201ENST00000619252 KIF1BO60333 1816 aa15.06■□□□□ 0
CU633967.1-201ENST00000619252 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CU633967.1-201ENST00000619252 SLAIN2Q9P270 581 aa15.06■□□□□ 0
CU633967.1-201ENST00000619252 JCADQ9P266 1359 aa15.06■□□□□ 0
CU633967.1-201ENST00000619252 SHPRHQ149N8 1683 aa15.06■□□□□ 0
CU633967.1-201ENST00000619252 DCCP43146 1447 aa15.05■□□□□ -0
CU633967.1-201ENST00000619252 C14orf37Q86TY3 774 aa15.04■□□□□ -0
CU633967.1-201ENST00000619252 CLTCL1P53675 1640 aa15.03■□□□□ -0
CU633967.1-201ENST00000619252 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.02■□□□□ -0
CU633967.1-201ENST00000619252 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CU633967.1-201ENST00000619252 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 ATF3P18847 181 aa15□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 C19orf44Q9H6X5 657 aa15□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 PTPRUQ92729 1446 aa15□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.99□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.98□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.97□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.97□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.97□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 NAIPQ13075 1403 aa14.96□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CU633967.1-201ENST00000619252 LRP6O75581 1613 aa14.95□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.95□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 POTEAQ6S8J7 498 aa14.95□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 PPLO60437 1756 aa14.93□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 HFM1A2PYH4 1435 aa14.93□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 MST1RQ04912 1400 aa14.93□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 PTCH1Q13635 1447 aa14.92□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 METP08581 1390 aa14.91□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 BRINP3Q76B58 766 aa14.91□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.91□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 LAMC1P11047 1609 aa14.9□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.9□□□□□ -0.02
CU633967.1-201ENST00000619252 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 TRIM52Q96A61 297 aa14.86□□□□□ -0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.86□□□□□ -0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 IFT172Q9UG01 1749 aa14.84□□□□□ -0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.84□□□□□ -0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.83□□□□□ -0.03
CU633967.1-201ENST00000619252 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.82□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.82□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.81□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.8□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 AFF2P51816 1311 aa14.79□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 RXRBP28702 533 aa14.78□□□□□ -0.04
CU633967.1-201ENST00000619252 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CU633967.1-201ENST00000619252 TECPR2O15040 1411 aa14.76□□□□□ -0.05
CU633967.1-201ENST00000619252 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.76□□□□□ -0.05
CU633967.1-201ENST00000619252 KIF1AQ12756 1690 aa14.75□□□□□ -0.05
CU633967.1-201ENST00000619252 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.75□□□□□ -0.05
CU633967.1-201ENST00000619252 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CU633967.1-201ENST00000619252 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CU633967.1-201ENST00000619252 C8orf37Q96NL8 207 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms