RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.04■□□□□ 0.96
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLIT1O75093 1534 aa21.04■□□□□ 0.96
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.03■□□□□ 0.96
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.01■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.01■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZFYVE9O95405 1425 aa21.01■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IQGAP1P46940 1657 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.98■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BCANQ96GW7 911 aa20.98■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EID1Q9Y6B2 187 aa20.98■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.98■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STRCQ7RTU9 1775 aa20.97■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.97■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LTKP29376 864 aa20.96■□□□□ 0.95
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYOM2P54296 1465 aa20.95■□□□□ 0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.95■□□□□ 0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.94■□□□□ 0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.93■□□□□ 0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.92■□□□□ 0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.89■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.88■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIK3C2GO75747 1445 aa20.87■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.87■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LAMC1P11047 1609 aa20.86■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.86■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.86■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MED14O60244 1454 aa20.85■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.85■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ALKQ9UM73 1620 aa20.85■□□□□ 0.93
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DIP2AQ14689 1571 aa20.83■□□□□ 0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.82■□□□□ 0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.81■□□□□ 0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.81■□□□□ 0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.8■□□□□ 0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.8■□□□□ 0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.79■□□□□ 0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STAC3Q96MF2 364 aa20.77■□□□□ 0.92
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.75■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 METP08581 1390 aa20.75■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.75■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADGRB1O14514 1584 aa20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STK26Q9P289 416 aa20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.72■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.72■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTPRUQ92729 1446 aa20.7■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBX22Q9Y458 520 aa20.7■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.7■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NWD1Q149M9 1564 aa20.69■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.67■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.66■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.65■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CPS1P31327 1500 aa20.64■□□□□ 0.9
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIK3R4Q99570 1358 aa20.63■□□□□ 0.89
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNA6P17658 529 aa20.63■□□□□ 0.89
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.61■□□□□ 0.89
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.6■□□□□ 0.89
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.59■□□□□ 0.89
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTCH1Q13635 1447 aa20.58■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.58■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP47Q96K76 1375 aa20.58■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.58■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DLC1Q96QB1 1528 aa20.58■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TECPR2O15040 1411 aa20.57■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.56■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRAM1Q96QH2 718 aa20.56■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POGKQ9P215 609 aa20.56■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABCC11Q96J66 1382 aa20.56■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.56■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C14orf37Q86TY3 774 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.53■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM94Q12767 1356 aa20.52■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms