RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613811.4

RAPGEFL1-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor like 1, human

TSL 1 (best)

Gene RAPGEFL1, Length 1,744 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		43.68	■■■■■ 4.58
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		43.68	■■■■■ 4.58
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		43.67	■■■■■ 4.58
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	43.65	■■■■■ 4.58
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		43.65	■■■■■ 4.58
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		43.62	■■■■■ 4.57
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PTPRM	P28827	1452 aa		43.59	■■■■■ 4.57
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	43.58	■■■■■ 4.57
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PIK3C2G	O75747	1445 aa		43.56	■■■■■ 4.56
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	LAMC1	P11047	1609 aa		43.55	■■■■■ 4.56
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.55	■■■■■ 4.56
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ZFYVE9	O95405	1425 aa		43.55	■■■■■ 4.56
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		43.53	■■■■■ 4.56
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		43.53	■■■■■ 4.56
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.52	■■■■■ 4.56
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	43.51	■■■■■ 4.56
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		43.51	■■■■■ 4.56
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		43.5	■■■■■ 4.55
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	43.49	■■■■■ 4.55
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	43.49	■■■■■ 4.55
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	43.49	■■■■■ 4.55
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	43.47	■■■■■ 4.55
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	USP47	Q96K76	1375 aa		43.45	■■■■■ 4.55
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		43.43	■■■■■ 4.54
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		43.42	■■■■■ 4.54
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	IQGAP1	P46940	1657 aa		43.4	■■■■■ 4.54
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.38	■■■■■ 4.53
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	43.36	■■■■■ 4.53
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SLIT1	O75093	1534 aa		43.36	■■■■■ 4.53
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		43.34	■■■■■ 4.53
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		43.33	■■■■■ 4.53
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.33	■■■■■ 4.53
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ADGRB1	O14514	1584 aa		43.32	■■■■■ 4.53
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43.3	■■■■■ 4.52
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.29	■■■■■ 4.52
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	43.28	■■■■■ 4.52
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ALK	Q9UM73	1620 aa		43.27	■■■■■ 4.52
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	43.27	■■■■■ 4.52
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		43.24	■■■■■ 4.51
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	LTK	P29376	864 aa		43.22	■■■■■ 4.51
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	43.21	■■■■■ 4.51
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		43.19	■■■■■ 4.51
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		43.18	■■■■■ 4.5
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		43.17	■■■■■ 4.5
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	EID1	Q9Y6B2	187 aa		43.15	■■■■■ 4.5
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.14	■■■■■ 4.5
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.06	■■■■■ 4.48
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		43.04	■■■■■ 4.48
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.02	■■■■■ 4.48
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		43.02	■■■■■ 4.48
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	43.02	■■■■■ 4.48
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TESK2	Q96S53	571 aa		43.01	■■■■■ 4.48
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CCDC7	Q96M83	1385 aa		42.99	■■■■■ 4.47
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MED14	O60244	1454 aa		42.99	■■■■■ 4.47
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MET	P08581	1390 aa		42.98	■■■■■ 4.47
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		42.98	■■■■■ 4.47
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		42.96	■■■■■ 4.47
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.96	■■■■■ 4.47
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.94	■■■■■ 4.47
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	STK26	Q9P289	416 aa		42.94	■■■■■ 4.46
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.92	■■■■■ 4.46
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.91	■■■■■ 4.46
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		42.89	■■■■■ 4.46
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.46
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.88	■■■■■ 4.46
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	DLC1	Q96QB1	1528 aa		42.87	■■■■■ 4.45
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.85	■■■■■ 4.45
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		42.84	■■■■■ 4.45
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TBX22	Q9Y458	520 aa		42.83	■■■■■ 4.45
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.83	■■■■■ 4.45
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TMF1	P82094	1093 aa		42.82	■■■■■ 4.44
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CPS1	P31327	1500 aa		42.79	■■■■■ 4.44
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TECPR2	O15040	1411 aa		42.79	■■■■■ 4.44
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		42.77	■■■■■ 4.44
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.77	■■■■■ 4.44
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.77	■■■■■ 4.44
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PRAM1	Q96QH2	718 aa		42.75	■■■■■ 4.43
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	HSPA2	P54652	639 aa		42.73	■■■■■ 4.43
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	42.71	■■■■■ 4.43
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SLC24A1	O60721	1099 aa		42.7	■■■■■ 4.43
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	POGK	Q9P215	609 aa		42.69	■■■■■ 4.42
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		42.68	■■■■■ 4.42
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		42.67	■■■■■ 4.42
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.67	■■■■■ 4.42
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.66	■■■■■ 4.42
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.66	■■■■■ 4.42
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.64	■■■■■ 4.42
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SIRT1	Q96EB6	747 aa		42.63	■■■■■ 4.42
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.62	■■■■■ 4.41

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