RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 MIA2Q96PC5 1412 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 FBXW7Q969H0 707 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 RAD21O60216 631 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 KLHL34Q8N239 644 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CTDP1-208ENST00000613122 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.83■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 GRIN2BQ13224 1484 aa24.83■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 ROCK1Q13464 1354 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 APPP05067 770 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 COG6Q9Y2V7 657 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 NLRP6P59044 892 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 RUNDC1Q96C34 613 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 PLIN1O60240 522 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 CEP89Q96ST8 783 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 PHF14O94880 888 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 CABP2Q9NPB3 220 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 NCAPD3P42695 1498 aa24.79■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 GNAI1P63096 354 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 HMOX1P09601 288 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 SYNJ2O15056 1496 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 PDE4CQ08493 712 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 AFAP1Q8N556 730 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.76■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.75■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM29Q14134 588 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 CRBNQ96SW2 442 aa24.73■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 TRDNQ13061 729 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 TPM3P06753 285 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 MCTP1Q6DN14 999 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 ABTB2Q8N961 1025 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 REC8O95072 547 aa24.71■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.7■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.7■■□□□ 1.55
CTDP1-208ENST00000613122 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 FAM161AQ3B820 660 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 CPLX1O14810 134 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.69■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 RNF20Q5VTR2 975 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 USP35Q9P2H5 1018 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 NCOA2Q15596 1464 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 TPM2P07951 284 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 ERICH2A1L162 156 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.66■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.64■■□□□ 1.54
CTDP1-208ENST00000613122 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.64■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 ERC2O15083 957 aa24.64■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.64■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 STRN4Q9NRL3 753 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 IFT140Q96RY7 1462 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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