RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.85■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.85■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.84■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 SLIT1O75093 1534 aa16.84■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 TRPM2O94759 1503 aa16.84■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.84■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.83■□□□□ 0.29
CCL3L3-201ENST00000612839 HRCP23327 699 aa16.83■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.83■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 CLTCL1P53675 1640 aa16.81■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.81■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.81■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 MED14O60244 1454 aa16.79■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 LTKP29376 864 aa16.78■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CCL3L3-201ENST00000612839 IQGAP1P46940 1657 aa16.77■□□□□ 0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 KIF1BO60333 1816 aa16.76■□□□□ 0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.76■□□□□ 0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFYVE9O95405 1425 aa16.76■□□□□ 0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 EID1Q9Y6B2 187 aa16.74■□□□□ 0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.73■□□□□ 0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.71■□□□□ 0.27
CCL3L3-201ENST00000612839 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.68■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.66■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.66■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 ABCB7O75027 752 aa16.65■□□□□ 0.26
CCL3L3-201ENST00000612839 PPLO60437 1756 aa16.64■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.63■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.63■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 IFT172Q9UG01 1749 aa16.62■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.62■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 BCANQ96GW7 911 aa16.61■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.61■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.61■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 RGL3Q3MIN7 710 aa16.61■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CERKQ8TCT0 537 aa16.61■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.61■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 CPS1P31327 1500 aa16.59■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 DIP2AQ14689 1571 aa16.58■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
CCL3L3-201ENST00000612839 POTEHQ6S545 545 aa16.58■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.58■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 TBX22Q9Y458 520 aa16.57■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 NWD1Q149M9 1564 aa16.56■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNA6P17658 529 aa16.54■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.54■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.54■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.54■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 ALKQ9UM73 1620 aa16.52■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 PIK3R4Q99570 1358 aa16.52■□□□□ 0.24
CCL3L3-201ENST00000612839 MYOM2P54296 1465 aa16.51■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 METP08581 1390 aa16.51■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 PIK3C2GO75747 1445 aa16.5■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 PTPRUQ92729 1446 aa16.5■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16.5■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.48■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.47■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.47■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXO41Q8TF61 875 aa16.46■□□□□ 0.23
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM94Q12767 1356 aa16.46■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.44■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.44■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 LAMC1P11047 1609 aa16.44■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 STAC3Q96MF2 364 aa16.43■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 NEUROD1Q13562 356 aa16.42■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.42■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.4■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.4■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.4■□□□□ 0.22
CCL3L3-201ENST00000612839 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.39■□□□□ 0.21
CCL3L3-201ENST00000612839 PTCH1Q13635 1447 aa16.39■□□□□ 0.21
CCL3L3-201ENST00000612839 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.39■□□□□ 0.21
CCL3L3-201ENST00000612839 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.38■□□□□ 0.21
CCL3L3-201ENST00000612839 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.38■□□□□ 0.21
CCL3L3-201ENST00000612839 ADGRB1O14514 1584 aa16.37■□□□□ 0.21
CCL3L3-201ENST00000612839 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms