RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD54-211ENST00000609454 NAIPQ13075 1403 aa28.83■■■□□ 2.21
ANKRD54-211ENST00000609454 KCNA6P17658 529 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD54-211ENST00000609454 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
ANKRD54-211ENST00000609454 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.79■■■□□ 2.2
ANKRD54-211ENST00000609454 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
ANKRD54-211ENST00000609454 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.78■■■□□ 2.2
ANKRD54-211ENST00000609454 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD54-211ENST00000609454 HFM1A2PYH4 1435 aa28.76■■■□□ 2.19
ANKRD54-211ENST00000609454 ZFYVE9O95405 1425 aa28.76■■■□□ 2.19
ANKRD54-211ENST00000609454 HSPA1LP34931 641 aa28.74■■■□□ 2.19
ANKRD54-211ENST00000609454 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.73■■■□□ 2.19
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
ANKRD54-211ENST00000609454 TBX22Q9Y458 520 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM94Q12767 1356 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD54-211ENST00000609454 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
ANKRD54-211ENST00000609454 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.67■■■□□ 2.18
ANKRD54-211ENST00000609454 C14orf37Q86TY3 774 aa28.63■■■□□ 2.17
ANKRD54-211ENST00000609454 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ANKRD54-211ENST00000609454 MSH6P52701 1360 aa28.61■■■□□ 2.17
ANKRD54-211ENST00000609454 TRPM2O94759 1503 aa28.58■■■□□ 2.17
ANKRD54-211ENST00000609454 ALKQ9UM73 1620 aa28.57■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 NWD1Q149M9 1564 aa28.56■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 DIP2AQ14689 1571 aa28.55■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.55■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 PIK3R4Q99570 1358 aa28.55■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 CLTCL1P53675 1640 aa28.54■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 FOXD1Q16676 465 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ANKRD54-211ENST00000609454 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.5■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF1BO60333 1816 aa28.48■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SLAIN2Q9P270 581 aa28.48■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.48■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 ATF3P18847 181 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.45■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.45■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.45■■■□□ 2.15
ANKRD54-211ENST00000609454 ILDR2Q71H61 639 aa28.44■■■□□ 2.14
ANKRD54-211ENST00000609454 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.44■■■□□ 2.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.42■■■□□ 2.14
ANKRD54-211ENST00000609454 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.42■■■□□ 2.14
ANKRD54-211ENST00000609454 RGL3Q3MIN7 710 aa28.4■■■□□ 2.14
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPRUQ92729 1446 aa28.4■■■□□ 2.14
ANKRD54-211ENST00000609454 METP08581 1390 aa28.38■■■□□ 2.13
ANKRD54-211ENST00000609454 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ANKRD54-211ENST00000609454 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD54-211ENST00000609454 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.35■■■□□ 2.13
ANKRD54-211ENST00000609454 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD54-211ENST00000609454 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ANKRD54-211ENST00000609454 SOCS7O14512 581 aa28.26■■■□□ 2.11
ANKRD54-211ENST00000609454 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.25■■■□□ 2.11
ANKRD54-211ENST00000609454 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.23■■■□□ 2.11
ANKRD54-211ENST00000609454 DCCP43146 1447 aa28.23■■■□□ 2.11
ANKRD54-211ENST00000609454 PPLO60437 1756 aa28.22■■■□□ 2.11
ANKRD54-211ENST00000609454 PHLPP1O60346 1717 aa28.21■■■□□ 2.11
ANKRD54-211ENST00000609454 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.2■■■□□ 2.11
ANKRD54-211ENST00000609454 BRINP3Q76B58 766 aa28.19■■■□□ 2.1
ANKRD54-211ENST00000609454 JCADQ9P266 1359 aa28.19■■■□□ 2.1
ANKRD54-211ENST00000609454 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.18■■■□□ 2.1
ANKRD54-211ENST00000609454 STK26Q9P289 416 aa28.18■■■□□ 2.1
ANKRD54-211ENST00000609454 PTCH1Q13635 1447 aa28.16■■■□□ 2.1
ANKRD54-211ENST00000609454 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.15■■■□□ 2.1
ANKRD54-211ENST00000609454 HRCP23327 699 aa28.14■■■□□ 2.1
ANKRD54-211ENST00000609454 MST1RQ04912 1400 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD54-211ENST00000609454 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD54-211ENST00000609454 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
ANKRD54-211ENST00000609454 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.07■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.07■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.06■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 PIK3C2GO75747 1445 aa28.05■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.04■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.04■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 IFT172Q9UG01 1749 aa28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.02■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCC11Q96J66 1382 aa28■■■□□ 2.07
ANKRD54-211ENST00000609454 DCAF11Q8TEB1 546 aa28■■■□□ 2.07
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