RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.43■□□□□ 0.54
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RABGEF1-209ENST00000607882 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRB3O60242 1522 aa18.36■□□□□ 0.53
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RABGEF1-209ENST00000607882 SLIT1O75093 1534 aa18.32■□□□□ 0.52
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZFYVE9O95405 1425 aa18.3■□□□□ 0.52
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RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.27■□□□□ 0.51
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RABGEF1-209ENST00000607882 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.25■□□□□ 0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.23■□□□□ 0.51
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RABGEF1-209ENST00000607882 C14orf37Q86TY3 774 aa18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.21■□□□□ 0.51
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RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.19■□□□□ 0.5
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RABGEF1-209ENST00000607882 NEUROD1Q13562 356 aa18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.18■□□□□ 0.5
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RABGEF1-209ENST00000607882 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TOM1O60784 492 aa18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.12■□□□□ 0.49
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RABGEF1-209ENST00000607882 IFT172Q9UG01 1749 aa17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 POGKQ9P215 609 aa17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
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