RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599766.5

FCHO1-229, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 747 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-229ENST00000599766 MSH6P52701 1360 aa26.46■■□□□ 1.83
FCHO1-229ENST00000599766 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 ADGRL2O95490 1459 aa26.44■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 PHLPP1O60346 1717 aa26.44■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 BCANQ96GW7 911 aa26.43■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.43■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 ZFYVE9O95405 1425 aa26.42■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 SLAIN2Q9P270 581 aa26.41■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.4■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.39■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 JCADQ9P266 1359 aa26.39■■□□□ 1.82
FCHO1-229ENST00000599766 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.36■■□□□ 1.81
FCHO1-229ENST00000599766 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.36■■□□□ 1.81
FCHO1-229ENST00000599766 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.36■■□□□ 1.81
FCHO1-229ENST00000599766 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
FCHO1-229ENST00000599766 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
FCHO1-229ENST00000599766 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
FCHO1-229ENST00000599766 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
FCHO1-229ENST00000599766 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.33■■□□□ 1.81
FCHO1-229ENST00000599766 TBX22Q9Y458 520 aa26.31■■□□□ 1.8
FCHO1-229ENST00000599766 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
FCHO1-229ENST00000599766 UNC13BO14795 1591 aa26.27■■□□□ 1.8
FCHO1-229ENST00000599766 DIP2AQ14689 1571 aa26.27■■□□□ 1.8
FCHO1-229ENST00000599766 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 LRP6O75581 1613 aa26.25■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.25■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.25■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 C14orf37Q86TY3 774 aa26.24■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 E9PCH4 1651 aa26.24■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 PIK3R4Q99570 1358 aa26.23■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 SHPRHQ149N8 1683 aa26.23■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.22■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.21■■□□□ 1.79
FCHO1-229ENST00000599766 ATF3P18847 181 aa26.19■■□□□ 1.78
FCHO1-229ENST00000599766 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
FCHO1-229ENST00000599766 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
FCHO1-229ENST00000599766 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
FCHO1-229ENST00000599766 TRPM2O94759 1503 aa26.17■■□□□ 1.78
FCHO1-229ENST00000599766 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.17■■□□□ 1.78
FCHO1-229ENST00000599766 BRINP3Q76B58 766 aa26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-229ENST00000599766 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-229ENST00000599766 DCCP43146 1447 aa26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-229ENST00000599766 PTPRUQ92729 1446 aa26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-229ENST00000599766 ROCK1Q13464 1354 aa26.1■■□□□ 1.77
FCHO1-229ENST00000599766 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
FCHO1-229ENST00000599766 TRIM52Q96A61 297 aa26.09■■□□□ 1.77
FCHO1-229ENST00000599766 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
FCHO1-229ENST00000599766 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.07■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.06■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 RXRBP28702 533 aa26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 NUP155O75694 1391 aa26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.04■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.03■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 MST1RQ04912 1400 aa26.02■■□□□ 1.76
FCHO1-229ENST00000599766 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26■■□□□ 1.75
FCHO1-229ENST00000599766 AFF2P51816 1311 aa25.98■■□□□ 1.75
FCHO1-229ENST00000599766 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
FCHO1-229ENST00000599766 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.95■■□□□ 1.74
FCHO1-229ENST00000599766 METP08581 1390 aa25.95■■□□□ 1.74
FCHO1-229ENST00000599766 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.92■■□□□ 1.74
FCHO1-229ENST00000599766 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
FCHO1-229ENST00000599766 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.9■■□□□ 1.74
FCHO1-229ENST00000599766 RGS12O14924 1447 aa25.88■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.88■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 C8orf37Q96NL8 207 aa25.88■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 ITGAEP38570 1179 aa25.87■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 CLTCL1P53675 1640 aa25.86■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 LAMC1P11047 1609 aa25.85■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.83■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 KIF1BO60333 1816 aa25.83■■□□□ 1.73
FCHO1-229ENST00000599766 PTCH1Q13635 1447 aa25.8■■□□□ 1.72
FCHO1-229ENST00000599766 NGLY1Q96IV0 654 aa25.78■■□□□ 1.72
FCHO1-229ENST00000599766 ADAMTS2O95450 1211 aa25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-229ENST00000599766 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
FCHO1-229ENST00000599766 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-229ENST00000599766 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-229ENST00000599766 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-229ENST00000599766 ORAI2Q96SN7 254 aa25.72■■□□□ 1.71
FCHO1-229ENST00000599766 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.71■■□□□ 1.71
FCHO1-229ENST00000599766 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
FCHO1-229ENST00000599766 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
FCHO1-229ENST00000599766 USP21Q9UK80 565 aa25.7■■□□□ 1.7
FCHO1-229ENST00000599766 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
FCHO1-229ENST00000599766 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
FCHO1-229ENST00000599766 HFM1A2PYH4 1435 aa25.67■■□□□ 1.7
FCHO1-229ENST00000599766 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-229ENST00000599766 ATRNO75882 1429 aa25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-229ENST00000599766 NAIPQ13075 1403 aa25.65■■□□□ 1.7
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