RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588358.5

ZNF444-208, Transcript of zinc finger protein 444, human

TSL 2

Gene ZNF444, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF444-208	ENST00000588358	NWD1	Q149M9	1564 aa		34.09	■■■■□ 3.05
ZNF444-208	ENST00000588358	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
ZNF444-208	ENST00000588358	BCAN	Q96GW7	911 aa		34.08	■■■■□ 3.05
ZNF444-208	ENST00000588358	SLAIN2	Q9P270	581 aa		34.06	■■■■□ 3.04
ZNF444-208	ENST00000588358	MSH6	P52701	1360 aa		34.05	■■■■□ 3.04
ZNF444-208	ENST00000588358	ADGRL2	O95490	1459 aa		34.01	■■■■□ 3.04
ZNF444-208	ENST00000588358	ZFYVE9	O95405	1425 aa		34	■■■■□ 3.03
ZNF444-208	ENST00000588358	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.98	■■■■□ 3.03
ZNF444-208	ENST00000588358	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.96	■■■■□ 3.03
ZNF444-208	ENST00000588358	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.96	■■■■□ 3.03
ZNF444-208	ENST00000588358	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.96	■■■■□ 3.03
ZNF444-208	ENST00000588358	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.96	■■■■□ 3.03
ZNF444-208	ENST00000588358	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.95	■■■■□ 3.03
ZNF444-208	ENST00000588358	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.94	■■■■□ 3.02
ZNF444-208	ENST00000588358	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.94	■■■■□ 3.02
ZNF444-208	ENST00000588358	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
ZNF444-208	ENST00000588358	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.92	■■■■□ 3.02
ZNF444-208	ENST00000588358	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.92	■■■■□ 3.02
ZNF444-208	ENST00000588358	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.91	■■■■□ 3.02
ZNF444-208	ENST00000588358	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ZNF444-208	ENST00000588358	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ZNF444-208	ENST00000588358	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ZNF444-208	ENST00000588358	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.86	■■■■□ 3.01
ZNF444-208	ENST00000588358	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.86	■■■■□ 3.01
ZNF444-208	ENST00000588358	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.86	■■■■□ 3.01
ZNF444-208	ENST00000588358	ITGAE	P38570	1179 aa		33.84	■■■■□ 3.01
ZNF444-208	ENST00000588358	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
ZNF444-208	ENST00000588358	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
ZNF444-208	ENST00000588358	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.82	■■■■□ 3
ZNF444-208	ENST00000588358	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.81	■■■■□ 3
ZNF444-208	ENST00000588358	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.81	■■■■□ 3
ZNF444-208	ENST00000588358	LRP6	O75581	1613 aa		33.8	■■■■□ 3
ZNF444-208	ENST00000588358	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.79	■■■■□ 3
ZNF444-208	ENST00000588358	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.78	■■■■□ 3
ZNF444-208	ENST00000588358	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.77	■■■■□ 3
ZNF444-208	ENST00000588358	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
ZNF444-208	ENST00000588358	ATF3	P18847	181 aa		33.74	■■■□□ 2.99
ZNF444-208	ENST00000588358	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ZNF444-208	ENST00000588358	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
ZNF444-208	ENST00000588358	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
ZNF444-208	ENST00000588358	UNC13B	O14795	1591 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ZNF444-208	ENST00000588358	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
ZNF444-208	ENST00000588358		E9PCH4	1651 aa		33.71	■■■□□ 2.99
ZNF444-208	ENST00000588358	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.69	■■■□□ 2.98
ZNF444-208	ENST00000588358	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.69	■■■□□ 2.98
ZNF444-208	ENST00000588358	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.68	■■■□□ 2.98
ZNF444-208	ENST00000588358	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.67	■■■□□ 2.98
ZNF444-208	ENST00000588358	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.66	■■■□□ 2.98
ZNF444-208	ENST00000588358	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.66	■■■□□ 2.98
ZNF444-208	ENST00000588358	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ZNF444-208	ENST00000588358	TRPM2	O94759	1503 aa		33.61	■■■□□ 2.97
ZNF444-208	ENST00000588358	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.6	■■■□□ 2.97
ZNF444-208	ENST00000588358	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ZNF444-208	ENST00000588358	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ZNF444-208	ENST00000588358	RXRB	P28702	533 aa		33.58	■■■□□ 2.97
ZNF444-208	ENST00000588358	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ZNF444-208	ENST00000588358	NUP155	O75694	1391 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ZNF444-208	ENST00000588358	DCC	P43146	1447 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ZNF444-208	ENST00000588358	NAIP	Q13075	1403 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ZNF444-208	ENST00000588358	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	MST1R	Q04912	1400 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	AFF2	P51816	1311 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	MET	P08581	1390 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
ZNF444-208	ENST00000588358	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
ZNF444-208	ENST00000588358	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		33.43	■■■□□ 2.94
ZNF444-208	ENST00000588358	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
ZNF444-208	ENST00000588358	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
ZNF444-208	ENST00000588358	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.37	■■■□□ 2.93
ZNF444-208	ENST00000588358	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
ZNF444-208	ENST00000588358	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.36	■■■□□ 2.93
ZNF444-208	ENST00000588358	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.36	■■■□□ 2.93
ZNF444-208	ENST00000588358	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		33.36	■■■□□ 2.93
ZNF444-208	ENST00000588358	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
ZNF444-208	ENST00000588358	RGS12	O14924	1447 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ZNF444-208	ENST00000588358	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
ZNF444-208	ENST00000588358	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ZNF444-208	ENST00000588358	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ZNF444-208	ENST00000588358	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		33.26	■■■□□ 2.92
ZNF444-208	ENST00000588358	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ZNF444-208	ENST00000588358	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ZNF444-208	ENST00000588358	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ZNF444-208	ENST00000588358	ORAI2	Q96SN7	254 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ZNF444-208	ENST00000588358	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ZNF444-208	ENST00000588358	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
ZNF444-208	ENST00000588358	LAMC1	P11047	1609 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ZNF444-208	ENST00000588358	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ZNF444-208	ENST00000588358	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
ZNF444-208	ENST00000588358	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ZNF444-208	ENST00000588358	USP21	Q9UK80	565 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ZNF444-208	ENST00000588358	KIF1B	O60333	1816 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ZNF444-208	ENST00000588358	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
ZNF444-208	ENST00000588358	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
ZNF444-208	ENST00000588358	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
ZNF444-208	ENST00000588358	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		33.08	■■■□□ 2.89

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms