RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43.31	■■■■■ 4.52
GPS1-225	ENST00000585084	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		43.3	■■■■■ 4.52
GPS1-225	ENST00000585084	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		43.3	■■■■■ 4.52
GPS1-225	ENST00000585084	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		43.29	■■■■■ 4.52
GPS1-225	ENST00000585084	ZFYVE9	O95405	1425 aa		43.28	■■■■■ 4.52
GPS1-225	ENST00000585084	ILDR2	Q71H61	639 aa		43.27	■■■■■ 4.52
GPS1-225	ENST00000585084	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.23	■■■■■ 4.51
GPS1-225	ENST00000585084	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.23	■■■■■ 4.51
GPS1-225	ENST00000585084	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.23	■■■■■ 4.51
GPS1-225	ENST00000585084	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	43.22	■■■■■ 4.51
GPS1-225	ENST00000585084	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.21	■■■■■ 4.51
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.2	■■■■■ 4.51
GPS1-225	ENST00000585084	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.49
GPS1-225	ENST00000585084	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.12	■■■■■ 4.49
GPS1-225	ENST00000585084	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.11	■■■■■ 4.49
GPS1-225	ENST00000585084	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.09	■■■■■ 4.49
GPS1-225	ENST00000585084	NAIP	Q13075	1403 aa		43.08	■■■■■ 4.49
GPS1-225	ENST00000585084	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
GPS1-225	ENST00000585084	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		43.05	■■■■■ 4.48
GPS1-225	ENST00000585084	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
GPS1-225	ENST00000585084	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.02	■■■■■ 4.48
GPS1-225	ENST00000585084	SOCS7	O14512	581 aa		43	■■■■■ 4.47
GPS1-225	ENST00000585084	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.98	■■■■■ 4.47
GPS1-225	ENST00000585084	MSH6	P52701	1360 aa		42.98	■■■■■ 4.47
GPS1-225	ENST00000585084	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		42.97	■■■■■ 4.47
GPS1-225	ENST00000585084	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.96	■■■■■ 4.47
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
GPS1-225	ENST00000585084	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.95	■■■■■ 4.47
GPS1-225	ENST00000585084	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.95	■■■■■ 4.47
GPS1-225	ENST00000585084	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.91	■■■■■ 4.46
GPS1-225	ENST00000585084	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
GPS1-225	ENST00000585084	TRPM2	O94759	1503 aa		42.86	■■■■■ 4.45
GPS1-225	ENST00000585084	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.85	■■■■■ 4.45
GPS1-225	ENST00000585084	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.85	■■■■■ 4.45
GPS1-225	ENST00000585084	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.83	■■■■■ 4.45
GPS1-225	ENST00000585084	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.83	■■■■■ 4.45
GPS1-225	ENST00000585084	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.83	■■■■■ 4.45
GPS1-225	ENST00000585084	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.8	■■■■■ 4.44
GPS1-225	ENST00000585084	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.8	■■■■■ 4.44
GPS1-225	ENST00000585084	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GPS1-225	ENST00000585084	KIF1B	O60333	1816 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GPS1-225	ENST00000585084	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GPS1-225	ENST00000585084	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GPS1-225	ENST00000585084	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GPS1-225	ENST00000585084	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.7	■■■■■ 4.43
GPS1-225	ENST00000585084	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.69	■■■■■ 4.42
GPS1-225	ENST00000585084	ATF3	P18847	181 aa		42.68	■■■■■ 4.42
GPS1-225	ENST00000585084	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.64	■■■■■ 4.42
GPS1-225	ENST00000585084	MET	P08581	1390 aa		42.63	■■■■■ 4.41
GPS1-225	ENST00000585084	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
GPS1-225	ENST00000585084	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
GPS1-225	ENST00000585084	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.59	■■■■■ 4.41
GPS1-225	ENST00000585084	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.57	■■■■■ 4.41
GPS1-225	ENST00000585084	FOXD1	Q16676	465 aa		42.54	■■■■■ 4.4
GPS1-225	ENST00000585084	DCC	P43146	1447 aa		42.51	■■■■■ 4.4
GPS1-225	ENST00000585084	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.5	■■■■■ 4.39
GPS1-225	ENST00000585084	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.49	■■■■■ 4.39
GPS1-225	ENST00000585084	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.45	■■■■■ 4.39
GPS1-225	ENST00000585084	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.43	■■■■■ 4.38
GPS1-225	ENST00000585084	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
GPS1-225	ENST00000585084	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GPS1-225	ENST00000585084	PPL	O60437	1756 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GPS1-225	ENST00000585084	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
GPS1-225	ENST00000585084	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.38	■■■■■ 4.38
GPS1-225	ENST00000585084	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.35	■■■■■ 4.37
GPS1-225	ENST00000585084	MST1R	Q04912	1400 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GPS1-225	ENST00000585084	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GPS1-225	ENST00000585084	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.34	■■■■■ 4.37
GPS1-225	ENST00000585084	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.33	■■■■■ 4.37
GPS1-225	ENST00000585084	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.3	■■■■■ 4.36
GPS1-225	ENST00000585084	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.3	■■■■■ 4.36
GPS1-225	ENST00000585084	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.29	■■■■■ 4.36
GPS1-225	ENST00000585084	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GPS1-225	ENST00000585084	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GPS1-225	ENST00000585084	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.26	■■■■■ 4.36
GPS1-225	ENST00000585084	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.25	■■■■■ 4.35
GPS1-225	ENST00000585084	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.24	■■■■■ 4.35
GPS1-225	ENST00000585084	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.23	■■■■■ 4.35
GPS1-225	ENST00000585084	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
GPS1-225	ENST00000585084	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.21	■■■■■ 4.35
GPS1-225	ENST00000585084	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.17	■■■■■ 4.34
GPS1-225	ENST00000585084	LRP6	O75581	1613 aa		42.16	■■■■■ 4.34
GPS1-225	ENST00000585084	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.16	■■■■■ 4.34
GPS1-225	ENST00000585084	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.15	■■■■■ 4.34
GPS1-225	ENST00000585084	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.15	■■■■■ 4.34
GPS1-225	ENST00000585084	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
GPS1-225	ENST00000585084	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	42.1	■■■■■ 4.33
GPS1-225	ENST00000585084	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	42.1	■■■■■ 4.33
GPS1-225	ENST00000585084	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	42.1	■■■■■ 4.33
GPS1-225	ENST00000585084	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
GPS1-225	ENST00000585084	STK26	Q9P289	416 aa		42.1	■■■■■ 4.33
GPS1-225	ENST00000585084	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.06	■■■■■ 4.32
GPS1-225	ENST00000585084	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.04	■■■■■ 4.32
GPS1-225	ENST00000585084	ORAI2	Q96SN7	254 aa		42.04	■■■■■ 4.32
GPS1-225	ENST00000585084	TECPR2	O15040	1411 aa		42.01	■■■■■ 4.32
GPS1-225	ENST00000585084	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.01	■■■■■ 4.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms