RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa38.81■■■■□ 3.8
SPNS1-209ENST00000567771 BCANQ96GW7 911 aa38.8■■■■□ 3.8
SPNS1-209ENST00000567771 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
SPNS1-209ENST00000567771 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
SPNS1-209ENST00000567771 RIMS2Q9UQ26 1411 aa38.79■■■■□ 3.8
SPNS1-209ENST00000567771 CHGAP10645 457 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
SPNS1-209ENST00000567771 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
SPNS1-209ENST00000567771 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa38.74■■■■□ 3.79
SPNS1-209ENST00000567771 HDGFP51858 240 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM94Q12767 1356 aa38.73■■■■□ 3.79
SPNS1-209ENST00000567771 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
SPNS1-209ENST00000567771 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
SPNS1-209ENST00000567771 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
SPNS1-209ENST00000567771 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP38.67■■■■□ 3.78
SPNS1-209ENST00000567771 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
SPNS1-209ENST00000567771 NWD1Q149M9 1564 aa38.65■■■■□ 3.78
SPNS1-209ENST00000567771 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
SPNS1-209ENST00000567771 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
SPNS1-209ENST00000567771 NAIPQ13075 1403 aa38.61■■■■□ 3.77
SPNS1-209ENST00000567771 TBX22Q9Y458 520 aa38.6■■■■□ 3.77
SPNS1-209ENST00000567771 SOCS7O14512 581 aa38.59■■■■□ 3.77
SPNS1-209ENST00000567771 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa38.55■■■■□ 3.76
SPNS1-209ENST00000567771 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
SPNS1-209ENST00000567771 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa38.54■■■■□ 3.76
SPNS1-209ENST00000567771 FAM135BQ49AJ0 1406 aa38.54■■■■□ 3.76
SPNS1-209ENST00000567771 MSH6P52701 1360 aa38.48■■■■□ 3.75
SPNS1-209ENST00000567771 HFM1A2PYH4 1435 aa38.46■■■■□ 3.75
SPNS1-209ENST00000567771 DIP2AQ14689 1571 aa38.45■■■■□ 3.75
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
SPNS1-209ENST00000567771 PIK3R4Q99570 1358 aa38.43■■■■□ 3.74
SPNS1-209ENST00000567771 TRIM52Q96A61 297 aa38.42■■■■□ 3.74
SPNS1-209ENST00000567771 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa38.4■■■■□ 3.74
SPNS1-209ENST00000567771 CLTCL1P53675 1640 aa38.39■■■■□ 3.74
SPNS1-209ENST00000567771 TRPM2O94759 1503 aa38.38■■■■□ 3.74
SPNS1-209ENST00000567771 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
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SPNS1-209ENST00000567771 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa38.37■■■■□ 3.73
SPNS1-209ENST00000567771 PTPRUQ92729 1446 aa38.36■■■■□ 3.73
SPNS1-209ENST00000567771 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa38.35■■■■□ 3.73
SPNS1-209ENST00000567771 C14orf37Q86TY3 774 aa38.33■■■■□ 3.73
SPNS1-209ENST00000567771 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa38.33■■■■□ 3.73
SPNS1-209ENST00000567771 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa38.31■■■■□ 3.72
SPNS1-209ENST00000567771 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
SPNS1-209ENST00000567771 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa38.28■■■■□ 3.72
SPNS1-209ENST00000567771 C19orf44Q9H6X5 657 aa38.26■■■■□ 3.72
SPNS1-209ENST00000567771 KIF1BO60333 1816 aa38.24■■■■□ 3.71
SPNS1-209ENST00000567771 METP08581 1390 aa38.23■■■■□ 3.71
SPNS1-209ENST00000567771 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
SPNS1-209ENST00000567771 CADPS2Q86UW7 1296 aa38.21■■■■□ 3.71
SPNS1-209ENST00000567771 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
SPNS1-209ENST00000567771 ATF3P18847 181 aa38.19■■■■□ 3.7
SPNS1-209ENST00000567771 PHLPP1O60346 1717 aa38.16■■■■□ 3.7
SPNS1-209ENST00000567771 FOXD1Q16676 465 aa38.15■■■■□ 3.7
SPNS1-209ENST00000567771 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
SPNS1-209ENST00000567771 VGFO15240 615 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
SPNS1-209ENST00000567771 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa38.09■■■■□ 3.69
SPNS1-209ENST00000567771 JCADQ9P266 1359 aa38.07■■■■□ 3.69
SPNS1-209ENST00000567771 DCCP43146 1447 aa38.06■■■■□ 3.68
SPNS1-209ENST00000567771 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
SPNS1-209ENST00000567771 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.04■■■■□ 3.68
SPNS1-209ENST00000567771 BRINP3Q76B58 766 aa38.03■■■■□ 3.68
SPNS1-209ENST00000567771 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.67
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SPNS1-209ENST00000567771 MST1RQ04912 1400 aa37.98■■■■□ 3.67
SPNS1-209ENST00000567771 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa37.98■■■■□ 3.67
SPNS1-209ENST00000567771 PPLO60437 1756 aa37.98■■■■□ 3.67
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.97■■■■□ 3.67
SPNS1-209ENST00000567771 POTEAQ6S8J7 498 aa37.94■■■■□ 3.66
SPNS1-209ENST00000567771 RGL3Q3MIN7 710 aa37.92■■■■□ 3.66
SPNS1-209ENST00000567771 PTCH1Q13635 1447 aa37.92■■■■□ 3.66
SPNS1-209ENST00000567771 NALCNQ8IZF0 1738 aa37.92■■■■□ 3.66
SPNS1-209ENST00000567771 ROBO2Q9HCK4 1378 aa37.92■■■■□ 3.66
SPNS1-209ENST00000567771 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.92■■■■□ 3.66
SPNS1-209ENST00000567771 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.89■■■■□ 3.66
SPNS1-209ENST00000567771 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.89■■■■□ 3.66
SPNS1-209ENST00000567771 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa37.88■■■■□ 3.66
SPNS1-209ENST00000567771 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.88■■■■□ 3.66
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SPNS1-209ENST00000567771 SHPRHQ149N8 1683 aa37.83■■■■□ 3.65
SPNS1-209ENST00000567771 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
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SPNS1-209ENST00000567771 C1orf167Q5SNV9 1468 aa37.79■■■■□ 3.64
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SPNS1-209ENST00000567771 IFT172Q9UG01 1749 aa37.76■■■■□ 3.64
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SPNS1-209ENST00000567771 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
SPNS1-209ENST00000567771 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
SPNS1-209ENST00000567771 ORAI2Q96SN7 254 aa37.71■■■■□ 3.63
SPNS1-209ENST00000567771 STK26Q9P289 416 aa37.7■■■■□ 3.63
SPNS1-209ENST00000567771 PIK3C2GO75747 1445 aa37.69■■■■□ 3.62
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM132EQ6IEE7 984 aa37.68■■■■□ 3.62
SPNS1-209ENST00000567771 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
SPNS1-209ENST00000567771 TECPR2O15040 1411 aa37.64■■■■□ 3.62
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
SPNS1-209ENST00000567771 WAPLQ7Z5K2 1190 aa37.64■■■■□ 3.62
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