RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.99■■■■□ 3.03
MEIS3-204ENST00000558555 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.98■■■■□ 3.03
MEIS3-204ENST00000558555 MYOM2P54296 1465 aa33.98■■■■□ 3.03
MEIS3-204ENST00000558555 STRCQ7RTU9 1775 aa33.97■■■■□ 3.03
MEIS3-204ENST00000558555 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.97■■■■□ 3.03
MEIS3-204ENST00000558555 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa33.94■■■■□ 3.02
MEIS3-204ENST00000558555 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.94■■■■□ 3.02
MEIS3-204ENST00000558555 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.91■■■■□ 3.02
MEIS3-204ENST00000558555 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
MEIS3-204ENST00000558555 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
MEIS3-204ENST00000558555 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa33.89■■■■□ 3.02
MEIS3-204ENST00000558555 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.86■■■■□ 3.01
MEIS3-204ENST00000558555 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa33.86■■■■□ 3.01
MEIS3-204ENST00000558555 ZFYVE9O95405 1425 aa33.85■■■■□ 3.01
MEIS3-204ENST00000558555 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.85■■■■□ 3.01
MEIS3-204ENST00000558555 HDGFP51858 240 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
MEIS3-204ENST00000558555 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
MEIS3-204ENST00000558555 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP33.82■■■■□ 3
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.82■■■■□ 3
MEIS3-204ENST00000558555 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
MEIS3-204ENST00000558555 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.8■■■■□ 3
MEIS3-204ENST00000558555 PIK3C2GO75747 1445 aa33.79■■■■□ 3
MEIS3-204ENST00000558555 CARD11Q9BXL7 1154 aa33.76■■■■□ 3
MEIS3-204ENST00000558555 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.75■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.74■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 LAMC1P11047 1609 aa33.73■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.73■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.73■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.73■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 SLIT1O75093 1534 aa33.72■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 EID1Q9Y6B2 187 aa33.71■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 CFAP70Q5T0N1 1121 aa33.7■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.7■■■□□ 2.99
MEIS3-204ENST00000558555 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
MEIS3-204ENST00000558555 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
MEIS3-204ENST00000558555 USP47Q96K76 1375 aa33.66■■■□□ 2.98
MEIS3-204ENST00000558555 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
MEIS3-204ENST00000558555 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.65■■■□□ 2.98
MEIS3-204ENST00000558555 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa33.65■■■□□ 2.98
MEIS3-204ENST00000558555 LTKP29376 864 aa33.6■■■□□ 2.97
MEIS3-204ENST00000558555 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
MEIS3-204ENST00000558555 ALKQ9UM73 1620 aa33.6■■■□□ 2.97
MEIS3-204ENST00000558555 BCANQ96GW7 911 aa33.59■■■□□ 2.97
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa33.59■■■□□ 2.97
MEIS3-204ENST00000558555 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
MEIS3-204ENST00000558555 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
MEIS3-204ENST00000558555 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
MEIS3-204ENST00000558555 IQGAP1P46940 1657 aa33.57■■■□□ 2.96
MEIS3-204ENST00000558555 ADGRB1O14514 1584 aa33.56■■■□□ 2.96
MEIS3-204ENST00000558555 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.55■■■□□ 2.96
MEIS3-204ENST00000558555 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa33.55■■■□□ 2.96
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.52■■■□□ 2.96
MEIS3-204ENST00000558555 CERKQ8TCT0 537 aa33.52■■■□□ 2.96
MEIS3-204ENST00000558555 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.96
MEIS3-204ENST00000558555 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
MEIS3-204ENST00000558555 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa33.48■■■□□ 2.95
MEIS3-204ENST00000558555 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa33.48■■■□□ 2.95
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
MEIS3-204ENST00000558555 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.45■■■□□ 2.95
MEIS3-204ENST00000558555 FBXO41Q8TF61 875 aa33.45■■■□□ 2.94
MEIS3-204ENST00000558555 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa33.44■■■□□ 2.94
MEIS3-204ENST00000558555 DIP2AQ14689 1571 aa33.43■■■□□ 2.94
MEIS3-204ENST00000558555 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
MEIS3-204ENST00000558555 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.42■■■□□ 2.94
MEIS3-204ENST00000558555 MED14O60244 1454 aa33.4■■■□□ 2.94
MEIS3-204ENST00000558555 STK26Q9P289 416 aa33.39■■■□□ 2.94
MEIS3-204ENST00000558555 TBX22Q9Y458 520 aa33.39■■■□□ 2.94
MEIS3-204ENST00000558555 SLC26A8Q96RN1 970 aa33.38■■■□□ 2.93
MEIS3-204ENST00000558555 METP08581 1390 aa33.38■■■□□ 2.93
MEIS3-204ENST00000558555 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
MEIS3-204ENST00000558555 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
MEIS3-204ENST00000558555 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
MEIS3-204ENST00000558555 TESK2Q96S53 571 aa33.31■■■□□ 2.92
MEIS3-204ENST00000558555 ABCC11Q96J66 1382 aa33.31■■■□□ 2.92
MEIS3-204ENST00000558555 SLC24A1O60721 1099 aa33.31■■■□□ 2.92
MEIS3-204ENST00000558555 DLC1Q96QB1 1528 aa33.3■■■□□ 2.92
MEIS3-204ENST00000558555 KNDC1Q76NI1 1749 aa33.3■■■□□ 2.92
MEIS3-204ENST00000558555 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.29■■■□□ 2.92
MEIS3-204ENST00000558555 TMF1P82094 1093 aa33.27■■■□□ 2.92
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC7Q96M83 1385 aa33.26■■■□□ 2.92
MEIS3-204ENST00000558555 PIK3R4Q99570 1358 aa33.26■■■□□ 2.92
MEIS3-204ENST00000558555 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.26■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa33.25■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 POGKQ9P215 609 aa33.25■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 TECPR2O15040 1411 aa33.24■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 KIF7Q2M1P5 1343 aa33.24■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 PRAM1Q96QH2 718 aa33.23■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 CPS1P31327 1500 aa33.22■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 SIRT1Q96EB6 747 aa33.21■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 PTPRUQ92729 1446 aa33.2■■■□□ 2.91
MEIS3-204ENST00000558555 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa33.19■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 FAM135BQ49AJ0 1406 aa33.19■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 CDCA8Q53HL2 280 aa33.19■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.19■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 DISP3Q9P2K9 1392 aa33.19■■■□□ 2.9
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