RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558550.1

EFTUD1P1-202, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD1P1, Length 418 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RIMS2Q9UQ26 1411 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLIT1O75093 1534 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NEUROD1Q13562 356 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 BCANQ96GW7 911 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LTKP29376 864 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.21□□□□□ -0.77
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PPLO60437 1756 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZFYVE9O95405 1425 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IFT172Q9UG01 1749 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IQGAP1P46940 1657 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MED14O60244 1454 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MSH5O43196 834 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TONSLQ96HA7 1378 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 STAC3Q96MF2 364 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MYOM2P54296 1465 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TBX22Q9Y458 520 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DIP2AQ14689 1571 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ALKQ9UM73 1620 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PIK3C2GO75747 1445 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LAMC1P11047 1609 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 METP08581 1390 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PIK3R4Q99570 1358 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KCNA6P17658 529 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.07□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 STK26Q9P289 416 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa10.06□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CPS1P31327 1500 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NBPF8Q3BBV2 869 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PTPRUQ92729 1446 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NWD1Q149M9 1564 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.02□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
EFTUD1P1-202ENST00000558550 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C14orf37Q86TY3 774 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CERKQ8TCT0 537 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ADGRB1O14514 1584 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ABCC11Q96J66 1382 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TMEM94Q12767 1356 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 POGKQ9P215 609 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 TECPR2O15040 1411 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PTCH1Q13635 1447 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 SIRT1Q96EB6 747 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 PRAM1Q96QH2 718 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 MSH6P52701 1360 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 DLC1Q96QB1 1528 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD1P1-202ENST00000558550 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD1P1-202ENST00000558550 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD1P1-202ENST00000558550 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD1P1-202ENST00000558550 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms