RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.93■■■□□ 2.06
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TSPAN3-204ENST00000558394 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.87■■■□□ 2.05
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TSPAN3-204ENST00000558394 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.28■■□□□ 1.96
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TSPAN3-204ENST00000558394 CLTCL1P53675 1640 aa27.15■■□□□ 1.94
TSPAN3-204ENST00000558394 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TSPAN3-204ENST00000558394 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TSPAN3-204ENST00000558394 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPAN3-204ENST00000558394 ATRNO75882 1429 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPAN3-204ENST00000558394 CCDC125Q86Z20 511 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPAN3-204ENST00000558394 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
TSPAN3-204ENST00000558394 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.07■■□□□ 1.92
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