RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558139.1

LHX4-202, Transcript of LIM homeobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene LHX4, Length 721 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4-202ENST00000558139 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.09■■■□□ 2.09
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LHX4-202ENST00000558139 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.07■■■□□ 2.08
LHX4-202ENST00000558139 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.06■■■□□ 2.08
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LHX4-202ENST00000558139 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
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LHX4-202ENST00000558139 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.03■■■□□ 2.08
LHX4-202ENST00000558139 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
LHX4-202ENST00000558139 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
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LHX4-202ENST00000558139 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.99■■■□□ 2.07
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LHX4-202ENST00000558139 KIF15Q9NS87 1388 aa27.97■■■□□ 2.07
LHX4-202ENST00000558139 C8orf37Q96NL8 207 aa27.96■■■□□ 2.07
LHX4-202ENST00000558139 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.96■■■□□ 2.07
LHX4-202ENST00000558139 TBX22Q9Y458 520 aa27.96■■■□□ 2.07
LHX4-202ENST00000558139 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.96■■■□□ 2.07
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LHX4-202ENST00000558139 NGLY1Q96IV0 654 aa27.95■■■□□ 2.06
LHX4-202ENST00000558139 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.95■■■□□ 2.06
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LHX4-202ENST00000558139 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.85■■■□□ 2.05
LHX4-202ENST00000558139 ZFYVE9O95405 1425 aa27.84■■■□□ 2.05
LHX4-202ENST00000558139 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
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LHX4-202ENST00000558139 CCDC125Q86Z20 511 aa27.82■■■□□ 2.04
LHX4-202ENST00000558139 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
LHX4-202ENST00000558139 PIK3R4Q99570 1358 aa27.8■■■□□ 2.04
LHX4-202ENST00000558139 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.8■■■□□ 2.04
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LHX4-202ENST00000558139 USP21Q9UK80 565 aa27.74■■■□□ 2.03
LHX4-202ENST00000558139 ABCC5O15440 1437 aa27.74■■■□□ 2.03
LHX4-202ENST00000558139 DCCP43146 1447 aa27.74■■■□□ 2.03
LHX4-202ENST00000558139 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.73■■■□□ 2.03
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LHX4-202ENST00000558139 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.28■■□□□ 1.96
LHX4-202ENST00000558139 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
LHX4-202ENST00000558139 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.27■■□□□ 1.96
LHX4-202ENST00000558139 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.26■■□□□ 1.95
LHX4-202ENST00000558139 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.25■■□□□ 1.95
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