RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551597.6

PSMA3-AS1-201, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSMA3-AS1, Length 507 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa17.05■□□□□ 0.32
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 MED14O60244 1454 aa17.05■□□□□ 0.32
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.04■□□□□ 0.32
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.04■□□□□ 0.32
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa17.03■□□□□ 0.32
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 LTKP29376 864 aa17.01■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.01■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 STRCP1A6NGW2 1772 aa16.98■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.98■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.98■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.97■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.96■□□□□ 0.31
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.95■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 DIP2AQ14689 1571 aa16.94■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NEUROD1Q13562 356 aa16.94■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 EID1Q9Y6B2 187 aa16.94■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 MYOM2P54296 1465 aa16.93■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RGL3Q3MIN7 710 aa16.92■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.92■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.91■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16.91■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.91■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NWD1Q149M9 1564 aa16.9■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.9■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.89■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 LAMC1P11047 1609 aa16.88■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ALKQ9UM73 1620 aa16.88■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PIK3C2GO75747 1445 aa16.87■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.87■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.87■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TONSLQ96HA7 1378 aa16.87■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.85■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.83■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.82■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PTPRUQ92729 1446 aa16.82■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 BCANQ96GW7 911 aa16.82■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.81■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.81■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CPS1P31327 1500 aa16.8■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 METP08581 1390 aa16.8■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TBX22Q9Y458 520 aa16.79■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ADGRB1O14514 1584 aa16.79■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.79■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.78■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.78■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PIK3R4Q99570 1358 aa16.77■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.77■□□□□ 0.28
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.74■□□□□ 0.27
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 KCNA6P17658 529 aa16.73■□□□□ 0.27
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.73■□□□□ 0.27
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 STAC3Q96MF2 364 aa16.72■□□□□ 0.27
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TECPR2O15040 1411 aa16.7■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PTCH1Q13635 1447 aa16.7■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.7■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.69■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.69■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.68■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.68■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 DLC1Q96QB1 1528 aa16.68■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.67■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CERKQ8TCT0 537 aa16.67■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TMEM94Q12767 1356 aa16.66■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ABCC11Q96J66 1382 aa16.64■□□□□ 0.26
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.64■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.63■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 STK26Q9P289 416 aa16.63■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.63■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.62■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.61■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.61■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.61■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.6■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ADGRB2O60241 1585 aa16.6■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.59■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.58■□□□□ 0.24
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.57■□□□□ 0.24
PSMA3-AS1-201ENST00000551597 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms