RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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PTPRB-208ENST00000550358 TPM3P06753 285 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRB-208ENST00000550358 FAM184AQ8NB25 1140 aa10.4□□□□□ -0.74
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PTPRB-208ENST00000550358 MARCH6O60337 910 aa10.4□□□□□ -0.74
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PTPRB-208ENST00000550358 RIPK4P57078 832 aa10.4□□□□□ -0.74
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PTPRB-208ENST00000550358 WDR97A6NE52 1622 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
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PTPRB-208ENST00000550358 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
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PTPRB-208ENST00000550358 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 ERICH2A1L162 156 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD45Q5TZF3 282 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRB-208ENST00000550358 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
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