RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 USP47Q96K76 1375 aa17■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 LAMC1P11047 1609 aa17■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRR-209ENST00000549308 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 NLRP1Q9C000 1473 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 PIK3C2GO75747 1445 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ZFYVE9O95405 1425 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.92■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 IQGAP1P46940 1657 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
PTPRR-209ENST00000549308 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC7Q96M83 1385 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 ADGRB1O14514 1584 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 PTPRMP28827 1452 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 ALKQ9UM73 1620 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 EID1Q9Y6B2 187 aa16.8■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 SLIT1O75093 1534 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 BCANQ96GW7 911 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 TESK2Q96S53 571 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 TMF1P82094 1093 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRR-209ENST00000549308 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 LTKP29376 864 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 MIER1Q8N108 512 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 STK26Q9P289 416 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 SLC24A1O60721 1099 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 CDCA8Q53HL2 280 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRR-209ENST00000549308 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 METP08581 1390 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 ANP32CO43423 234 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 POGKQ9P215 609 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 DLC1Q96QB1 1528 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 PRAM1Q96QH2 718 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 ABCC11Q96J66 1382 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 DIP2AQ14689 1571 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 MED14O60244 1454 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRR-209ENST00000549308 TBX22Q9Y458 520 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 EVC2Q86UK5 1308 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 CPS1P31327 1500 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 TECPR2O15040 1411 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 SIRT1Q96EB6 747 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 MYOM1P52179 1685 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 PTPRUQ92729 1446 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 PANK3Q9H999 370 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRR-209ENST00000549308 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms