RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.76■■■□□ 2.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.74■■■□□ 2.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.74■■■□□ 2.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCC5O15440 1437 aa29.73■■■□□ 2.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.71■■■□□ 2.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 NOS1P29475 1434 aa29.7■■■□□ 2.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 DAPK1P53355 1430 aa29.7■■■□□ 2.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADGRB3O60242 1522 aa29.69■■■□□ 2.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM52Q96A61 297 aa29.67■■■□□ 2.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.65■■■□□ 2.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 RXRBP28702 533 aa29.64■■■□□ 2.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.64■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 C14orf37Q86TY3 774 aa29.63■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.63■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.63■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRP6O75581 1613 aa29.63■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 TBX22Q9Y458 520 aa29.62■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.6■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZFYVE9O95405 1425 aa29.59■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATF3P18847 181 aa29.58■■■□□ 2.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.54■■■□□ 2.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHPRHQ149N8 1683 aa29.53■■■□□ 2.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIK3R4Q99570 1358 aa29.51■■■□□ 2.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRINP3Q76B58 766 aa29.46■■■□□ 2.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADGRL2O95490 1459 aa29.45■■■□□ 2.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 AFF2P51816 1311 aa29.44■■■□□ 2.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 DIP2AQ14689 1571 aa29.43■■■□□ 2.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.42■■■□□ 2.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.42■■■□□ 2.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITGAEP38570 1179 aa29.4■■■□□ 2.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCCP43146 1447 aa29.39■■■□□ 2.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.39■■■□□ 2.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.39■■■□□ 2.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.38■■■□□ 2.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.38■■■□□ 2.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.37■■■□□ 2.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.33■■■□□ 2.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRPM2O94759 1503 aa29.33■■■□□ 2.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOXD1Q16676 465 aa29.32■■■□□ 2.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 C8orf37Q96NL8 207 aa29.31■■■□□ 2.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.3■■■□□ 2.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGS12O14924 1447 aa29.3■■■□□ 2.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 NGLY1Q96IV0 654 aa29.3■■■□□ 2.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPRUQ92729 1446 aa29.27■■■□□ 2.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 ROCK1Q13464 1354 aa29.26■■■□□ 2.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 MST1RQ04912 1400 aa29.25■■■□□ 2.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.23■■■□□ 2.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.22■■■□□ 2.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.21■■■□□ 2.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.18■■■□□ 2.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 UNC13BO14795 1591 aa29.18■■■□□ 2.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 E9PCH4 1651 aa29.15■■■□□ 2.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADAMTS2O95450 1211 aa29.14■■■□□ 2.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
CD27-AS1-208ENST00000538616 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.12■■■□□ 2.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP21Q9UK80 565 aa29.12■■■□□ 2.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.11■■■□□ 2.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC125Q86Z20 511 aa29.1■■■□□ 2.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 METP08581 1390 aa29.08■■■□□ 2.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CD27-AS1-208ENST00000538616 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.05■■■□□ 2.24
CD27-AS1-208ENST00000538616 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.05■■■□□ 2.24
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUP155O75694 1391 aa29.05■■■□□ 2.24
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTCH1Q13635 1447 aa29.04■■■□□ 2.24
CD27-AS1-208ENST00000538616 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.04■■■□□ 2.24
CD27-AS1-208ENST00000538616 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CD27-AS1-208ENST00000538616 NAIPQ13075 1403 aa29.02■■■□□ 2.24
CD27-AS1-208ENST00000538616 LAMC1P11047 1609 aa28.98■■■□□ 2.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATRNO75882 1429 aa28.98■■■□□ 2.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.95■■■□□ 2.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 ORAI2Q96SN7 254 aa28.95■■■□□ 2.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 HFM1A2PYH4 1435 aa28.92■■■□□ 2.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 EP400Q96L91 3159 aa28.92■■■□□ 2.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.86■■■□□ 2.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms