RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 BARGINQ6ZT62 677 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC102AQ96A19 550 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 SLF2Q8IX21 1173 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 PPP4CP60510 307 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 WBP1LQ9NX94 342 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 NLRP7Q8WX94 980 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 NECTIN2Q92692 538 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 PHOX2BQ99453 314 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-214ENST00000530727 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-214ENST00000530727 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-214ENST00000530727 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-214ENST00000530727 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-214ENST00000530727 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-214ENST00000530727 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-214ENST00000530727 AK7Q96M32 723 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-214ENST00000530727 SULF1Q8IWU6 871 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-214ENST00000530727 RDH13Q8NBN7 331 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-214ENST00000530727 SLC10A3P09131 477 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 CLCN1P35523 988 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 APLP1P51693 650 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 PRR14Q9BWN1 585 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 CFHP08603 1231 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM66O15016 1216 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 AMHR2Q16671 573 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRC-214ENST00000530727 CD46P15529 392 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 MTRQ99707 1265 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 COPS2P61201 443 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 GCGRP47871 477 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 KCNC4Q03721 635 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 PDE4DQ08499 809 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 IL21Q9HBE4 155 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 FUT2Q10981 343 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-214ENST00000530727 IFFO2Q5TF58 517 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF516Q92618 1163 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 KDM4AO75164 1064 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 ATP6V1AP38606 617 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 ZPR1O75312 459 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 NR1I2O75469 434 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 MS4A1P11836 297 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 USP46P62068 366 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 MORN1Q5T089 497 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 TLL1O43897 1013 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0G2JS52 829 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 HOXA2O43364 376 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRC-214ENST00000530727 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 HLA-CQ95604 372 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 NEUROD2Q15784 382 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 ADH1BP00325 375 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 SPSB2Q99619 263 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 GGCXP38435 758 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 GUCA2AQ02747 115 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 Q3C1V9 767 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 FDX1P10109 184 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFV2P19404 249 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 THAP11Q96EK4 314 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 S1PR4O95977 384 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 BRICD5Q6PL45 260 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.12
PTPRC-214ENST00000530727 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 FAM117AQ9C073 453 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8□□□□□ -1.13
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