RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527677.1

TSTA3-207, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-207ENST00000527677 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.18■■□□□ 1.46
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TSTA3-207ENST00000527677 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.17■■□□□ 1.46
TSTA3-207ENST00000527677 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-207ENST00000527677 TONSLQ96HA7 1378 aa24.16■■□□□ 1.46
TSTA3-207ENST00000527677 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-207ENST00000527677 RGL3Q3MIN7 710 aa24.15■■□□□ 1.46
TSTA3-207ENST00000527677 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.15■■□□□ 1.46
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TSTA3-207ENST00000527677 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-207ENST00000527677 MYOM2P54296 1465 aa24.13■■□□□ 1.45
TSTA3-207ENST00000527677 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
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TSTA3-207ENST00000527677 HSPA2P54652 639 aa24.09■■□□□ 1.45
TSTA3-207ENST00000527677 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.08■■□□□ 1.45
TSTA3-207ENST00000527677 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
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TSTA3-207ENST00000527677 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.05■■□□□ 1.44
TSTA3-207ENST00000527677 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
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TSTA3-207ENST00000527677 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24■■□□□ 1.43
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TSTA3-207ENST00000527677 USP47Q96K76 1375 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-207ENST00000527677 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.6■■□□□ 1.37
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TSTA3-207ENST00000527677 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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TSTA3-207ENST00000527677 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-207ENST00000527677 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-207ENST00000527677 TMEM94Q12767 1356 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-207ENST00000527677 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-207ENST00000527677 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-207ENST00000527677 DCCP43146 1447 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-207ENST00000527677 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-207ENST00000527677 C14orf37Q86TY3 774 aa23.52■■□□□ 1.36
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