RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 DNAJB2P25686 324 aa9.09□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 AMHR2Q16671 573 aa9.08□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 AK7Q96M32 723 aa9.08□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 RGS20O76081 388 aa9.06□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 SLC10A3P09131 477 aa9.06□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.06□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 STAC3Q96MF2 364 aa9.06□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 WBP1LQ9NX94 342 aa9.05□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 LRCH3Q96II8 777 aa9.04□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.03□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.03□□□□□ -0.96
CLVS1-209ENST00000522928 PDE4DQ08499 809 aa9.01□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.01□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 APLP1P51693 650 aa9□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 PTPN5P54829 565 aa9□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.99□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 MS4A1P11836 297 aa8.98□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLF2Q8IX21 1173 aa8.98□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 CD46P15529 392 aa8.97□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 CLCN1P35523 988 aa8.97□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CLVS1-209ENST00000522928 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 PPP4CP60510 307 aa8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 GCGRP47871 477 aa8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 RNF40O75150 1001 aa8.93□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 CFHP08603 1231 aa8.92□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 IFFO2Q5TF58 517 aa8.92□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.9□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.9□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 SULF1Q8IWU6 871 aa8.9□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.9□□□□□ -0.98
CLVS1-209ENST00000522928 RDH13Q8NBN7 331 aa8.89□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.87□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 FUT2Q10981 343 aa8.87□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF516Q92618 1163 aa8.87□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 HLA-CQ95604 372 aa8.87□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.87□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 FAM117AQ9C073 453 aa8.87□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 A0A0G2JS52 829 aa8.86□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.86□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 MORN1Q5T089 497 aa8.85□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.85□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 MTRQ99707 1265 aa8.85□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 KDM4AO75164 1064 aa8.84□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 Q6ZNB5 142 aa8.84□□□□□ -0.99
CLVS1-209ENST00000522928 SLC4A3P48751 1232 aa8.83□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 NEUROD2Q15784 382 aa8.83□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.83□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.83□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 NECTIN2Q92692 538 aa8.83□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 HOXA2O43364 376 aa8.82□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 COPS2P61201 443 aa8.82□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.82□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.82□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.82□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.82□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 ATP6V1AP38606 617 aa8.81□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 GUCA2AQ02747 115 aa8.81□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.81□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.81□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 THAP11Q96EK4 314 aa8.81□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 PRR14Q9BWN1 585 aa8.81□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.8□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 LCE2BO14633 110 aa8.8□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 NDUFV2P19404 249 aa8.8□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 IL21Q9HBE4 155 aa8.79□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 ZPR1O75312 459 aa8.78□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 USP46P62068 366 aa8.78□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.78□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CLVS1-209ENST00000522928 TLL1O43897 1013 aa8.77□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 SPTLC1O15269 473 aa8.76□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 BRICD5Q6PL45 260 aa8.76□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.76□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 IL27Q8NEV9 243 aa8.76□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.76□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.76□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 KCNC4Q03721 635 aa8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 NR1I2O75469 434 aa8.73□□□□□ -1.01
CLVS1-209ENST00000522928 GJA5P36382 358 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms