RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1-206ENST00000520462 BCANQ96GW7 911 aa23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1-206ENST00000520462 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRB3O60242 1522 aa23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1-206ENST00000520462 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNA6P17658 529 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM94Q12767 1356 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-206ENST00000520462 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1-206ENST00000520462 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TSNARE1-206ENST00000520462 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.92■■□□□ 1.26
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1-206ENST00000520462 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1-206ENST00000520462 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.89■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 TRPM2O94759 1503 aa22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 ZFYVE9O95405 1425 aa22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 NWD1Q149M9 1564 aa22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF1BO60333 1816 aa22.87■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 MSH6P52701 1360 aa22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 CLTCL1P53675 1640 aa22.85■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
TSNARE1-206ENST00000520462 FOXD1Q16676 465 aa22.82■■□□□ 1.24
TSNARE1-206ENST00000520462 HRCP23327 699 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-206ENST00000520462 C14orf37Q86TY3 774 aa22.81■■□□□ 1.24
TSNARE1-206ENST00000520462 SLAIN2Q9P270 581 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-206ENST00000520462 TBX22Q9Y458 520 aa22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-206ENST00000520462 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TSNARE1-206ENST00000520462 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.76■■□□□ 1.23
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.74■■□□□ 1.23
TSNARE1-206ENST00000520462 PHLPP1O60346 1717 aa22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1-206ENST00000520462 DIP2AQ14689 1571 aa22.72■■□□□ 1.23
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 PIK3R4Q99570 1358 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 ATF3P18847 181 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 JCADQ9P266 1359 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 POTEAQ6S8J7 498 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1-206ENST00000520462 PPLO60437 1756 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 RGL3Q3MIN7 710 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPRUQ92729 1446 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1-206ENST00000520462 IFT172Q9UG01 1749 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-206ENST00000520462 METP08581 1390 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-206ENST00000520462 BRINP3Q76B58 766 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-206ENST00000520462 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-206ENST00000520462 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-206ENST00000520462 LRP6O75581 1613 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-206ENST00000520462 DCCP43146 1447 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-206ENST00000520462 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 SHPRHQ149N8 1683 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 MST1RQ04912 1400 aa22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-206ENST00000520462 MYOM2P54296 1465 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-206ENST00000520462 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-206ENST00000520462 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-206ENST00000520462 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-206ENST00000520462 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-206ENST00000520462 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-206ENST00000520462 PIK3C2GO75747 1445 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-206ENST00000520462 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-206ENST00000520462 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TSNARE1-206ENST00000520462 STAC3Q96MF2 364 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 LAMC1P11047 1609 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms