RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516908.1

RNU6-352P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 352, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-352P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-352P-201ENST00000516908 GPR153Q6NV75 609 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 JPH4Q96JJ6 628 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 FBXW7Q969H0 707 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 ABCC2Q92887 1545 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 KIF21BO75037 1637 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 AMHR2Q16671 573 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 IL27Q8NEV9 243 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 SAMD9Q5K651 1589 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 RIMBP2O15034 1052 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAM117AQ9C073 453 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 LHX6Q9UPM6 363 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 DIP2BQ9P265 1576 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAM161AQ3B820 660 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 PHOX2BQ99453 314 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-352P-201ENST00000516908 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.65□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 TSPOAP1O95153 1857 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 ABCA8O94911 1581 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 PADI6Q6TGC4 694 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 OTUD5Q96G74 571 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 TTC13Q8NBP0 860 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 COL9A1P20849 921 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 CERKQ8TCT0 537 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 NLRP7Q8WX94 980 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 MAPKBP1O60336 1514 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 SNPHO15079 494 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 MS4A1P11836 297 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 PTPRGP23470 1445 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 ARID3CA6NKF2 412 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 PRSS12P56730 875 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-352P-201ENST00000516908 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.59□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 EEA1Q15075 1411 aa6.59□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 GOLGA3Q08378 1498 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 C3orf80F5H4A9 247 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 OATP04181 439 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 CLCN1P35523 988 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 ASXL2Q76L83 1435 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 UACAQ9BZF9 1416 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 TSKSQ9UJT2 592 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 PTPREP23469 700 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 LHX8Q68G74 356 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 C14orf37Q86TY3 774 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 KIF14Q15058 1648 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 EYA1Q99502 592 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 ATP10BO94823 1461 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-352P-201ENST00000516908 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms