RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 MTMR7Q9Y216 660 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 PRSS12P56730 875 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 RCCD1A6NED2 376 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 LILRB3O75022 631 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 AP1G2O75843 785 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.46□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 USP17L8P0C7I0 530 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 NDUFV2P19404 249 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 EYA1Q99502 592 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.43□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 SLC39A7Q92504 469 aa8.42□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 C3orf80F5H4A9 247 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 GPR37L1O60883 481 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 GJA5P36382 358 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 SULF1Q8IWU6 871 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 ZNF428Q96B54 188 aa8.41□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 PDE4CQ08493 712 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.4□□□□□ -1.06
HERC3-209ENST00000504994 COL9A1P20849 921 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 RFX1P22670 979 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 TSKSQ9UJT2 592 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 CARNS1A5YM72 827 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 NUDT7P0C024 238 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 KCNA1Q09470 495 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 METRNQ9UJH8 293 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 USTQ9Y2C2 406 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 GABBR2O75899 941 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 BRD1O95696 1058 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 C7P10643 843 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 DNAJB2P25686 324 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.37□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.36□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 VAC14Q08AM6 782 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 WASHC4Q2M389 1173 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 RDH13Q8NBN7 331 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-209ENST00000504994 HOXA2O43364 376 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 KDM4AO75164 1064 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 ARSIQ5FYB1 569 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 PNMA3Q9UL41 463 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 NBPF26B4DH59 902 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 GUCA2AQ02747 115 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 TATDN2Q93075 761 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 HLA-CQ95604 372 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 UCN2Q96RP3 112 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 FDX1P10109 184 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 ALG2Q9H553 416 aa8.31□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.3□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 SMAPO00193 183 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 GCGRP47871 477 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 USP46P62068 366 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.29□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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