RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR37O15354 613 aa9.17□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDE4DQ08499 809 aa9.17□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UACAQ9BZF9 1416 aa9.17□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.16□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.16□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.16□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NEFLP07196 543 aa9.15□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC184Q52MB2 194 aa9.15□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.15□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIF3CO14782 793 aa9.14□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.14□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.14□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.14□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAP3K9P80192 1104 aa9.14□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EVX2Q03828 476 aa9.14□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUTM2FA1L443 756 aa9.13□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.13□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OCEL1Q9H607 264 aa9.13□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KDM6BO15054 1643 aa9.12□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANP32EQ9BTT0 268 aa9.12□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.11□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HAX1O00165 279 aa9.11□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.11□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 G3V3G9 751 aa9.1□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM117AQ9C073 453 aa9.1□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DDX12PQ92771 950 aa9.1□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OSBPP22059 807 aa9.09□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.09□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC102AQ96A19 550 aa9.09□□□□□ -0.95
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.08□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HOMEZQ8IX15 550 aa9.08□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HECW1Q76N89 1606 aa9.08□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.08□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FECHP22830 423 aa9.08□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.08□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAP2K5Q13163 448 aa9.07□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.07□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IRF6O14896 467 aa9.06□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLCG2P16885 1265 aa9.06□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IER5LQ5T953 404 aa9.06□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.06□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPRGP23470 1445 aa9.06□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCA8O94911 1581 aa9.06□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.05□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GNPATO15228 680 aa9.05□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OXER1Q8TDS5 423 aa9.05□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.04□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.03□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC7Q96M83 1385 aa9.02□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTGER2P43116 358 aa9.02□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HIC1Q14526 733 aa9.02□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRS2Q9HD23 443 aa9.02□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.02□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.02□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FCHSD2O94868 740 aa9.01□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLCN6P51797 869 aa9.01□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.01□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EVI5O60447 810 aa9.01□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AMHR2Q16671 573 aa9.01□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.01□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIF7Q2M1P5 1343 aa9□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCC5O15440 1437 aa9□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBC1D12O60347 775 aa9□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCC2Q92887 1545 aa9□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DAPK1P53355 1430 aa9□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NCOA1Q15788 1441 aa9□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MIA2Q96PC5 1412 aa9□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.99□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP10BO94823 1461 aa8.99□□□□□ -0.97
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SEC24BO95487 1268 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms