RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 CLTCL1P53675 1640 aa19.58■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 HSPA1LP34931 641 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 PIP4K2BP78356 416 aa19.54■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 EID1Q9Y6B2 187 aa19.54■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.53■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.53■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 BCANQ96GW7 911 aa19.52■□□□□ 0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF1BO60333 1816 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 RGL3Q3MIN7 710 aa19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 MYO5BQ9ULV0 1848 aa19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 HDGFP51858 240 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 TOM1O60784 492 aa19.48■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 RIMS2Q9UQ26 1411 aa19.48■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 NEUROD1Q13562 356 aa19.46■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 SLIT1O75093 1534 aa19.46■□□□□ 0.71
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.45■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 CPS1P31327 1500 aa19.45■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.44■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 LTKP29376 864 aa19.44■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 MED14O60244 1454 aa19.42■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 ALKQ9UM73 1620 aa19.42■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.41■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFYVE9O95405 1425 aa19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.4■□□□□ 0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.39■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 IQGAP1P46940 1657 aa19.38■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa19.37■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.36■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.35■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.34■□□□□ 0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
PGGT1B-204ENST00000503638 PPLO60437 1756 aa19.33■□□□□ 0.68
PGGT1B-204ENST00000503638 TONSLQ96HA7 1378 aa19.32■□□□□ 0.68
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.3■□□□□ 0.68
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
PGGT1B-204ENST00000503638 IFT172Q9UG01 1749 aa19.28■□□□□ 0.68
PGGT1B-204ENST00000503638 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.26■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 MYOM2P54296 1465 aa19.26■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.25■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa19.25■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 TBX22Q9Y458 520 aa19.24■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.24■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 DIP2AQ14689 1571 aa19.23■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 STAC3Q96MF2 364 aa19.22■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 PIK3C2GO75747 1445 aa19.22■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.22■□□□□ 0.67
PGGT1B-204ENST00000503638 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.19■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 METP08581 1390 aa19.19■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNA6P17658 529 aa19.18■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 STK26Q9P289 416 aa19.18■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.17■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.17■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.17■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 LAMC1P11047 1609 aa19.16■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 PIK3R4Q99570 1358 aa19.16■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 C14orf37Q86TY3 774 aa19.15■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.15■□□□□ 0.66
PGGT1B-204ENST00000503638 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM94Q12767 1356 aa19.13■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.12■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 PTPRUQ92729 1446 aa19.11■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNA4P22459 653 aa19.11■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 NWD1Q149M9 1564 aa19.1■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 POTEAQ6S8J7 498 aa19.09■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.09■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
PGGT1B-204ENST00000503638 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.08■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.07■□□□□ 0.64
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.07■□□□□ 0.64
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