RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 ZFYVE9O95405 1425 aa30.69■■■□□ 2.5
TTYH3-207ENST00000498454 IFT172Q9UG01 1749 aa30.67■■■□□ 2.5
TTYH3-207ENST00000498454 PPLO60437 1756 aa30.67■■■□□ 2.5
TTYH3-207ENST00000498454 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.66■■■□□ 2.5
TTYH3-207ENST00000498454 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
TTYH3-207ENST00000498454 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.62■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.62■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 EID1Q9Y6B2 187 aa30.62■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 LTKP29376 864 aa30.61■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 TONSLQ96HA7 1378 aa30.59■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 STRCQ7RTU9 1775 aa30.59■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.58■■■□□ 2.49
TTYH3-207ENST00000498454 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
TTYH3-207ENST00000498454 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.57■■■□□ 2.48
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TTYH3-207ENST00000498454 MYOM2P54296 1465 aa30.55■■■□□ 2.48
TTYH3-207ENST00000498454 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
TTYH3-207ENST00000498454 MED14O60244 1454 aa30.52■■■□□ 2.48
TTYH3-207ENST00000498454 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.52■■■□□ 2.48
TTYH3-207ENST00000498454 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.52■■■□□ 2.48
TTYH3-207ENST00000498454 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.51■■■□□ 2.48
TTYH3-207ENST00000498454 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
TTYH3-207ENST00000498454 STAC3Q96MF2 364 aa30.5■■■□□ 2.47
TTYH3-207ENST00000498454 IQGAP1P46940 1657 aa30.49■■■□□ 2.47
TTYH3-207ENST00000498454 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.48■■■□□ 2.47
TTYH3-207ENST00000498454 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.48■■■□□ 2.47
TTYH3-207ENST00000498454 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
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TTYH3-207ENST00000498454 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.45■■■□□ 2.47
TTYH3-207ENST00000498454 PIK3C2GO75747 1445 aa30.44■■■□□ 2.46
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TTYH3-207ENST00000498454 FBXO41Q8TF61 875 aa30.42■■■□□ 2.46
TTYH3-207ENST00000498454 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.4■■■□□ 2.46
TTYH3-207ENST00000498454 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.4■■■□□ 2.46
TTYH3-207ENST00000498454 DIP2AQ14689 1571 aa30.38■■■□□ 2.45
TTYH3-207ENST00000498454 ALKQ9UM73 1620 aa30.37■■■□□ 2.45
TTYH3-207ENST00000498454 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.37■■■□□ 2.45
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TTYH3-207ENST00000498454 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.36■■■□□ 2.45
TTYH3-207ENST00000498454 LAMC1P11047 1609 aa30.36■■■□□ 2.45
TTYH3-207ENST00000498454 TBX22Q9Y458 520 aa30.33■■■□□ 2.45
TTYH3-207ENST00000498454 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.32■■■□□ 2.44
TTYH3-207ENST00000498454 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.32■■■□□ 2.44
TTYH3-207ENST00000498454 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
TTYH3-207ENST00000498454 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.32■■■□□ 2.44
TTYH3-207ENST00000498454 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.29■■■□□ 2.44
TTYH3-207ENST00000498454 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.27■■■□□ 2.44
TTYH3-207ENST00000498454 METP08581 1390 aa30.26■■■□□ 2.43
TTYH3-207ENST00000498454 PIK3R4Q99570 1358 aa30.24■■■□□ 2.43
TTYH3-207ENST00000498454 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
TTYH3-207ENST00000498454 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.22■■■□□ 2.43
TTYH3-207ENST00000498454 ADGRB1O14514 1584 aa30.22■■■□□ 2.43
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TTYH3-207ENST00000498454 CERKQ8TCT0 537 aa30.21■■■□□ 2.43
TTYH3-207ENST00000498454 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.2■■■□□ 2.43
TTYH3-207ENST00000498454 PTPRUQ92729 1446 aa30.2■■■□□ 2.42
TTYH3-207ENST00000498454 NWD1Q149M9 1564 aa30.18■■■□□ 2.42
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TTYH3-207ENST00000498454 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
TTYH3-207ENST00000498454 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
TTYH3-207ENST00000498454 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
TTYH3-207ENST00000498454 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
TTYH3-207ENST00000498454 KCNA6P17658 529 aa30.15■■■□□ 2.42
TTYH3-207ENST00000498454 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.14■■■□□ 2.41
TTYH3-207ENST00000498454 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
TTYH3-207ENST00000498454 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.13■■■□□ 2.41
TTYH3-207ENST00000498454 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.13■■■□□ 2.41
TTYH3-207ENST00000498454 STK26Q9P289 416 aa30.11■■■□□ 2.41
TTYH3-207ENST00000498454 ABCC11Q96J66 1382 aa30.09■■■□□ 2.41
TTYH3-207ENST00000498454 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
TTYH3-207ENST00000498454 TECPR2O15040 1411 aa30.08■■■□□ 2.41
TTYH3-207ENST00000498454 CPS1P31327 1500 aa30.07■■■□□ 2.4
TTYH3-207ENST00000498454 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.07■■■□□ 2.4
TTYH3-207ENST00000498454 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.05■■■□□ 2.4
TTYH3-207ENST00000498454 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.05■■■□□ 2.4
TTYH3-207ENST00000498454 DLC1Q96QB1 1528 aa30.05■■■□□ 2.4
TTYH3-207ENST00000498454 PTCH1Q13635 1447 aa30.05■■■□□ 2.4
TTYH3-207ENST00000498454 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TTYH3-207ENST00000498454 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.03■■■□□ 2.4
TTYH3-207ENST00000498454 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
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TTYH3-207ENST00000498454 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.98■■■□□ 2.39
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TTYH3-207ENST00000498454 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.95■■■□□ 2.39
TTYH3-207ENST00000498454 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
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TTYH3-207ENST00000498454 PRAM1Q96QH2 718 aa29.94■■■□□ 2.38
TTYH3-207ENST00000498454 TMEM94Q12767 1356 aa29.93■■■□□ 2.38
TTYH3-207ENST00000498454 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
TTYH3-207ENST00000498454 POGKQ9P215 609 aa29.93■■■□□ 2.38
TTYH3-207ENST00000498454 USP47Q96K76 1375 aa29.92■■■□□ 2.38
TTYH3-207ENST00000498454 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TTYH3-207ENST00000498454 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TTYH3-207ENST00000498454 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
TTYH3-207ENST00000498454 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
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