RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 STAC3Q96MF2 364 aa22.27■■□□□ 1.16
SYP-208ENST00000494396 REREQ9P2R6 1566 aa22.26■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.25■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 NUDCQ9Y266 331 aa22.25■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.22■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.21■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.21■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 AGLP35573 1532 aa22.21■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 LAMC1P11047 1609 aa22.21■■□□□ 1.15
SYP-208ENST00000494396 KIF1BO60333 1816 aa22.2■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.18■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 USP35Q9P2H5 1018 aa22.18■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.18■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 NOS1P29475 1434 aa22.17■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 MADDQ8WXG6 1647 aa22.17■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.17■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 NBR1Q14596 966 aa22.16■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.16■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 ADGRB3O60242 1522 aa22.14■■□□□ 1.14
SYP-208ENST00000494396 MYOM2P54296 1465 aa22.13■■□□□ 1.13
SYP-208ENST00000494396 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.13■■□□□ 1.13
SYP-208ENST00000494396 MROH2AA6NES4 1674 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-208ENST00000494396 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.11■■□□□ 1.13
SYP-208ENST00000494396 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYP-208ENST00000494396 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SYP-208ENST00000494396 SYNMO15061 1565 aa22.1■■□□□ 1.13
SYP-208ENST00000494396 PIK3C2BO00750 1634 aa22.09■■□□□ 1.13
SYP-208ENST00000494396 IFT172Q9UG01 1749 aa22.08■■□□□ 1.13
SYP-208ENST00000494396 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.07■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.06■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.05■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 MS4A1P11836 297 aa22.04■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 MLECQ14165 292 aa22.03■■□□□ 1.12
SYP-208ENST00000494396 IDI1Q13907 227 aa22.02■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 IQGAP1P46940 1657 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 PPLO60437 1756 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 ERVK-7P63135 1459 aa22.01■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 TESK2Q96S53 571 aa22■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.98■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 PIK3C2GO75747 1445 aa21.96■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.95■■□□□ 1.11
SYP-208ENST00000494396 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 PDE3BQ13370 1112 aa21.95■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.95■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 TMF1P82094 1093 aa21.94■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.94■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.93■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.93■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 TMC1Q8TDI8 760 aa21.92■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.92■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 INSRP06213 1382 aa21.91■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 RALBP1Q15311 655 aa21.91■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.91■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 ZFYVE9O95405 1425 aa21.9■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 ZMYM3Q14202 1370 aa21.9■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 BACH2Q9BYV9 841 aa21.89■■□□□ 1.1
SYP-208ENST00000494396 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 PDE4AP27815 886 aa21.87■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.87■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 SLC24A1O60721 1099 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 NEFMP07197 916 aa21.86■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 CDCA8Q53HL2 280 aa21.85■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 ADGRB1O14514 1584 aa21.84■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.83■■□□□ 1.09
SYP-208ENST00000494396 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.81■■□□□ 1.08
SYP-208ENST00000494396 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.8■■□□□ 1.08
SYP-208ENST00000494396 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SYP-208ENST00000494396 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.8■■□□□ 1.08
SYP-208ENST00000494396 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.79■■□□□ 1.08
SYP-208ENST00000494396 PANK3Q9H999 370 aa21.79■■□□□ 1.08
SYP-208ENST00000494396 TNRQ92752 1358 aa21.78■■□□□ 1.08
SYP-208ENST00000494396 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.78■■□□□ 1.08
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