RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf80F5H4A9 247 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRC-212ENST00000491302 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.72□□□□□ -0.05
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PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.71□□□□□ -0.05
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PTPRC-212ENST00000491302 ST18O60284 1047 aa14.7□□□□□ -0.06
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PTPRC-212ENST00000491302 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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PTPRC-212ENST00000491302 COG6Q9Y2V7 657 aa14.5□□□□□ -0.09
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PTPRC-212ENST00000491302 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
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PTPRC-212ENST00000491302 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.45□□□□□ -0.1
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PTPRC-212ENST00000491302 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRC-212ENST00000491302 USP17L8P0C7I0 530 aa14.41□□□□□ -0.1
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1AP38606 617 aa14.41□□□□□ -0.1
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PTPRC-212ENST00000491302 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.41□□□□□ -0.1
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
PTPRC-212ENST00000491302 RNF40O75150 1001 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRC-212ENST00000491302 FUT2Q10981 343 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.4□□□□□ -0.1
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