RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485085.5

CHST10-211, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 10, humanhuman

TSL 4

Gene CHST10, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST10-211ENST00000485085 ROCK1Q13464 1354 aa28.64■■■□□ 2.18
CHST10-211ENST00000485085 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
CHST10-211ENST00000485085 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.63■■■□□ 2.17
CHST10-211ENST00000485085 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.63■■■□□ 2.17
CHST10-211ENST00000485085 SLAIN2Q9P270 581 aa28.6■■■□□ 2.17
CHST10-211ENST00000485085 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.6■■■□□ 2.17
CHST10-211ENST00000485085 ADGRB3O60242 1522 aa28.59■■■□□ 2.17
CHST10-211ENST00000485085 MSH6P52701 1360 aa28.56■■■□□ 2.16
CHST10-211ENST00000485085 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CHST10-211ENST00000485085 NWD1Q149M9 1564 aa28.54■■■□□ 2.16
CHST10-211ENST00000485085 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CHST10-211ENST00000485085 ZFYVE9O95405 1425 aa28.52■■■□□ 2.16
CHST10-211ENST00000485085 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.51■■■□□ 2.15
CHST10-211ENST00000485085 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.5■■■□□ 2.15
CHST10-211ENST00000485085 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CHST10-211ENST00000485085 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CHST10-211ENST00000485085 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CHST10-211ENST00000485085 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.48■■■□□ 2.15
CHST10-211ENST00000485085 TBX22Q9Y458 520 aa28.47■■■□□ 2.15
CHST10-211ENST00000485085 JCADQ9P266 1359 aa28.46■■■□□ 2.15
CHST10-211ENST00000485085 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CHST10-211ENST00000485085 PHLPP1O60346 1717 aa28.45■■■□□ 2.14
CHST10-211ENST00000485085 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CHST10-211ENST00000485085 C14orf37Q86TY3 774 aa28.43■■■□□ 2.14
CHST10-211ENST00000485085 NAIPQ13075 1403 aa28.43■■■□□ 2.14
CHST10-211ENST00000485085 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.42■■■□□ 2.14
CHST10-211ENST00000485085 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.41■■■□□ 2.14
CHST10-211ENST00000485085 UNC13BO14795 1591 aa28.41■■■□□ 2.14
CHST10-211ENST00000485085 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
CHST10-211ENST00000485085 HFM1A2PYH4 1435 aa28.38■■■□□ 2.13
CHST10-211ENST00000485085 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.36■■■□□ 2.13
CHST10-211ENST00000485085 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CHST10-211ENST00000485085 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CHST10-211ENST00000485085 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.35■■■□□ 2.13
CHST10-211ENST00000485085 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.35■■■□□ 2.13
CHST10-211ENST00000485085 ATF3P18847 181 aa28.34■■■□□ 2.13
CHST10-211ENST00000485085 LRP6O75581 1613 aa28.33■■■□□ 2.13
CHST10-211ENST00000485085 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.33■■■□□ 2.13
CHST10-211ENST00000485085 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 NUP155O75694 1391 aa28.3■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.3■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.3■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 E9PCH4 1651 aa28.29■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 TRIM52Q96A61 297 aa28.28■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.28■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 PTPRUQ92729 1446 aa28.26■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 PIK3R4Q99570 1358 aa28.26■■■□□ 2.12
CHST10-211ENST00000485085 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CHST10-211ENST00000485085 BRINP3Q76B58 766 aa28.26■■■□□ 2.11
CHST10-211ENST00000485085 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CHST10-211ENST00000485085 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CHST10-211ENST00000485085 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CHST10-211ENST00000485085 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
CHST10-211ENST00000485085 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CHST10-211ENST00000485085 DIP2AQ14689 1571 aa28.21■■■□□ 2.11
CHST10-211ENST00000485085 TRPM2O94759 1503 aa28.18■■■□□ 2.1
CHST10-211ENST00000485085 RXRBP28702 533 aa28.17■■■□□ 2.1
CHST10-211ENST00000485085 SHPRHQ149N8 1683 aa28.16■■■□□ 2.1
CHST10-211ENST00000485085 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.14■■■□□ 2.1
CHST10-211ENST00000485085 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CHST10-211ENST00000485085 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CHST10-211ENST00000485085 METP08581 1390 aa28.11■■■□□ 2.09
CHST10-211ENST00000485085 AFF2P51816 1311 aa28.11■■■□□ 2.09
CHST10-211ENST00000485085 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.09■■■□□ 2.09
CHST10-211ENST00000485085 MST1RQ04912 1400 aa28.09■■■□□ 2.09
CHST10-211ENST00000485085 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.08■■■□□ 2.09
CHST10-211ENST00000485085 DCCP43146 1447 aa28.08■■■□□ 2.09
CHST10-211ENST00000485085 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CHST10-211ENST00000485085 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.06■■■□□ 2.08
CHST10-211ENST00000485085 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CHST10-211ENST00000485085 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.04■■■□□ 2.08
CHST10-211ENST00000485085 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CHST10-211ENST00000485085 C8orf37Q96NL8 207 aa28.03■■■□□ 2.08
CHST10-211ENST00000485085 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CHST10-211ENST00000485085 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.99■■■□□ 2.07
CHST10-211ENST00000485085 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CHST10-211ENST00000485085 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.98■■■□□ 2.07
CHST10-211ENST00000485085 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.98■■■□□ 2.07
CHST10-211ENST00000485085 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.98■■■□□ 2.07
CHST10-211ENST00000485085 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.97■■■□□ 2.07
CHST10-211ENST00000485085 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CHST10-211ENST00000485085 ADAMTS2O95450 1211 aa27.95■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 FOXD1Q16676 465 aa27.93■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 NGLY1Q96IV0 654 aa27.93■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 HRCP23327 699 aa27.92■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 ORAI2Q96SN7 254 aa27.92■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.92■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 RGS12O14924 1447 aa27.92■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.9■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.9■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 CLTCL1P53675 1640 aa27.9■■■□□ 2.06
CHST10-211ENST00000485085 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.86■■■□□ 2.05
CHST10-211ENST00000485085 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CHST10-211ENST00000485085 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CHST10-211ENST00000485085 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CHST10-211ENST00000485085 USP21Q9UK80 565 aa27.82■■■□□ 2.04
CHST10-211ENST00000485085 KIF1BO60333 1816 aa27.79■■■□□ 2.04
CHST10-211ENST00000485085 PTCH1Q13635 1447 aa27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms