RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 IL21Q9HBE4 155 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJB2P25686 324 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 TJAP1Q5JTD0 557 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 LCE2BO14633 110 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 GPR37O15354 613 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 SLF2Q8IX21 1173 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R18Q6NYC8 613 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 MTRQ99707 1265 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 FECHP22830 423 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 NECTIN2Q92692 538 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 RCCD1A6NED2 376 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 OATP04181 439 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF787Q6DD87 383 aa10.29□□□□□ -0.76
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PTPRC-211ENST00000484135 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
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PTPRC-211ENST00000484135 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM134Q9H6X4 195 aa10.27□□□□□ -0.77
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PTPRC-211ENST00000484135 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-211ENST00000484135 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF516Q92618 1163 aa10.21□□□□□ -0.77
PTPRC-211ENST00000484135 MAP2K5Q13163 448 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-211ENST00000484135 PRR14Q9BWN1 585 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRC-211ENST00000484135 CFHP08603 1231 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRC-211ENST00000484135 KMT5BQ4FZB7 885 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRC-211ENST00000484135 NLRP7Q8WX94 980 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRC-211ENST00000484135 SLC24A1O60721 1099 aa10.17□□□□□ -0.78
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PTPRC-211ENST00000484135 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRC-211ENST00000484135 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.16□□□□□ -0.78
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PTPRC-211ENST00000484135 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRC-211ENST00000484135 PHOX2BQ99453 314 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRC-211ENST00000484135 SLC10A3P09131 477 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRC-211ENST00000484135 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRC-211ENST00000484135 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRC-211ENST00000484135 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC102AQ96A19 550 aa10.13□□□□□ -0.79
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PTPRC-211ENST00000484135 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRC-211ENST00000484135 SULF1Q8IWU6 871 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRC-211ENST00000484135 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRC-211ENST00000484135 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.1□□□□□ -0.79
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PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRC-211ENST00000484135 SLC19A1P41440 591 aa10.07□□□□□ -0.8
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PTPRC-211ENST00000484135 ZMYND10O75800 440 aa10.05□□□□□ -0.8
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PTPRC-211ENST00000484135 TLL1O43897 1013 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRC-211ENST00000484135 NR1I2O75469 434 aa10.04□□□□□ -0.8
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PTPRC-211ENST00000484135 CLCN1P35523 988 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 FUT2Q10981 343 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 GPCPD1Q9NPB8 672 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 GCGRP47871 477 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 MYT1Q01538 1121 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 BCANQ96GW7 911 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 SPRYD7Q5W111 196 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM67Q6ZTA4 783 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 CD46P15529 392 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 PRR20EP86478 221 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 PRR20CP86479 221 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 PRR20DP86480 221 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 PRR20BP86481 221 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 PRR20AP86496 221 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 FAM187AA6NFU0 413 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 ATP6V1AP38606 617 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 ADH1BP00325 375 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-211ENST00000484135 MORN1Q5T089 497 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 S1PR4O95977 384 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 KDM4AO75164 1064 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 SPSB2Q99619 263 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 AMHR2Q16671 573 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 POTECB2RU33 542 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 TNFRSF10AO00220 468 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 AK7Q96M32 723 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-211ENST00000484135 TREML4Q6UXN2 200 aa9.9□□□□□ -0.82
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