RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481995.5

HOXB-AS3-211, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 523 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ADGRB3O60242 1522 aa20.36■□□□□ 0.85
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 C14orf37Q86TY3 774 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-211ENST00000481995 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.31■□□□□ 0.84
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.25■□□□□ 0.83
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.21■□□□□ 0.83
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TBX22Q9Y458 520 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ADGRL2O95490 1459 aa20.16■□□□□ 0.82
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.92■□□□□ 0.78
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 NALCNQ8IZF0 1738 aa19.91■□□□□ 0.78
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ITGAEP38570 1179 aa19.88■□□□□ 0.77
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NUP155O75694 1391 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXB-AS3-211ENST00000481995 METP08581 1390 aa19.86■□□□□ 0.77
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa19.85■□□□□ 0.77
HOXB-AS3-211ENST00000481995 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PTCH1Q13635 1447 aa19.84■□□□□ 0.77
HOXB-AS3-211ENST00000481995 LAMC1P11047 1609 aa19.81■□□□□ 0.76
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ATRNO75882 1429 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CCDC125Q86Z20 511 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa19.8■□□□□ 0.76
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ORAI2Q96SN7 254 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXB-AS3-211ENST00000481995 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.76■□□□□ 0.75
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