RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
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C9orf3-216ENST00000478603 BCANQ96GW7 911 aa34.78■■■■□ 3.16
C9orf3-216ENST00000478603 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.77■■■■□ 3.16
C9orf3-216ENST00000478603 KCNA6P17658 529 aa34.75■■■■□ 3.15
C9orf3-216ENST00000478603 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
C9orf3-216ENST00000478603 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.71■■■■□ 3.15
C9orf3-216ENST00000478603 TMEM94Q12767 1356 aa34.7■■■■□ 3.15
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C9orf3-216ENST00000478603 NWD1Q149M9 1564 aa34.68■■■■□ 3.14
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C9orf3-216ENST00000478603 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.65■■■■□ 3.14
C9orf3-216ENST00000478603 NAIPQ13075 1403 aa34.64■■■■□ 3.14
C9orf3-216ENST00000478603 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
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C9orf3-216ENST00000478603 HFM1A2PYH4 1435 aa34.49■■■■□ 3.11
C9orf3-216ENST00000478603 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.49■■■■□ 3.11
C9orf3-216ENST00000478603 SOCS7O14512 581 aa34.49■■■■□ 3.11
C9orf3-216ENST00000478603 CLTCL1P53675 1640 aa34.48■■■■□ 3.11
C9orf3-216ENST00000478603 MSH6P52701 1360 aa34.48■■■■□ 3.11
C9orf3-216ENST00000478603 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.47■■■■□ 3.11
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C9orf3-216ENST00000478603 TRPM2O94759 1503 aa34.45■■■■□ 3.1
C9orf3-216ENST00000478603 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.42■■■■□ 3.1
C9orf3-216ENST00000478603 PIK3R4Q99570 1358 aa34.41■■■■□ 3.1
C9orf3-216ENST00000478603 KIF1BO60333 1816 aa34.4■■■■□ 3.1
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C9orf3-216ENST00000478603 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.36■■■■□ 3.09
C9orf3-216ENST00000478603 C14orf37Q86TY3 774 aa34.36■■■■□ 3.09
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C9orf3-216ENST00000478603 SLAIN2Q9P270 581 aa34.36■■■■□ 3.09
C9orf3-216ENST00000478603 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.35■■■■□ 3.09
C9orf3-216ENST00000478603 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.35■■■■□ 3.09
C9orf3-216ENST00000478603 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
C9orf3-216ENST00000478603 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.34■■■■□ 3.09
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C9orf3-216ENST00000478603 PHLPP1O60346 1717 aa34.27■■■■□ 3.08
C9orf3-216ENST00000478603 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.25■■■■□ 3.07
C9orf3-216ENST00000478603 FOXD1Q16676 465 aa34.24■■■■□ 3.07
C9orf3-216ENST00000478603 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.22■■■■□ 3.07
C9orf3-216ENST00000478603 ATF3P18847 181 aa34.21■■■■□ 3.07
C9orf3-216ENST00000478603 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
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C9orf3-216ENST00000478603 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
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C9orf3-216ENST00000478603 JCADQ9P266 1359 aa34.09■■■■□ 3.05
C9orf3-216ENST00000478603 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
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C9orf3-216ENST00000478603 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.06■■■■□ 3.04
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C9orf3-216ENST00000478603 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.04■■■■□ 3.04
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C9orf3-216ENST00000478603 SETD5Q9C0A6 1442 aa34■■■■□ 3.03
C9orf3-216ENST00000478603 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.98■■■■□ 3.03
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C9orf3-216ENST00000478603 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
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C9orf3-216ENST00000478603 TECPR2O15040 1411 aa33.74■■■□□ 2.99
C9orf3-216ENST00000478603 KNDC1Q76NI1 1749 aa33.73■■■□□ 2.99
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