RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 STRCQ7RTU9 1775 aa29.02■■■□□ 2.24
ACTB-210ENST00000477812 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.01■■■□□ 2.23
ACTB-210ENST00000477812 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
ACTB-210ENST00000477812 LTKP29376 864 aa29.01■■■□□ 2.23
ACTB-210ENST00000477812 RGL3Q3MIN7 710 aa29.01■■■□□ 2.23
ACTB-210ENST00000477812 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
ACTB-210ENST00000477812 NEUROD1Q13562 356 aa28.98■■■□□ 2.23
ACTB-210ENST00000477812 MED14O60244 1454 aa28.97■■■□□ 2.23
ACTB-210ENST00000477812 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.97■■■□□ 2.23
ACTB-210ENST00000477812 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.96■■■□□ 2.23
ACTB-210ENST00000477812 MYOM2P54296 1465 aa28.95■■■□□ 2.22
ACTB-210ENST00000477812 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.94■■■□□ 2.22
ACTB-210ENST00000477812 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.223e-11■■■■□ 24.1
ACTB-210ENST00000477812 EID1Q9Y6B2 187 aa28.94■■■□□ 2.22
ACTB-210ENST00000477812 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.92■■■□□ 2.22
ACTB-210ENST00000477812 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
ACTB-210ENST00000477812 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.91■■■□□ 2.22
ACTB-210ENST00000477812 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
ACTB-210ENST00000477812 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
ACTB-210ENST00000477812 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.89■■■□□ 2.22
ACTB-210ENST00000477812 IQGAP1P46940 1657 aa28.89■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.88■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.88■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.87■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.86■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 TONSLQ96HA7 1378 aa28.86■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 PIK3C2GO75747 1445 aa28.86■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 STAC3Q96MF2 364 aa28.84■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.84■■■□□ 2.21
ACTB-210ENST00000477812 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.79■■■□□ 2.2
ACTB-210ENST00000477812 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.79■■■□□ 2.2
ACTB-210ENST00000477812 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
ACTB-210ENST00000477812 DIP2AQ14689 1571 aa28.79■■■□□ 2.2
ACTB-210ENST00000477812 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.78■■■□□ 2.2
ACTB-210ENST00000477812 ALKQ9UM73 1620 aa28.76■■■□□ 2.2
ACTB-210ENST00000477812 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
ACTB-210ENST00000477812 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.75■■■□□ 2.19
ACTB-210ENST00000477812 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.73■■■□□ 2.19
ACTB-210ENST00000477812 LAMC1P11047 1609 aa28.72■■■□□ 2.19
ACTB-210ENST00000477812 TBX22Q9Y458 520 aa28.72■■■□□ 2.19
ACTB-210ENST00000477812 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.71■■■□□ 2.19
ACTB-210ENST00000477812 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 BCANQ96GW7 911 aa28.69■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 METP08581 1390 aa28.69■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.69■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.67■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 ADGRB1O14514 1584 aa28.67■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.66■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 PIK3R4Q99570 1358 aa28.65■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.65■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 NWD1Q149M9 1564 aa28.64■■■□□ 2.18
ACTB-210ENST00000477812 PTPRUQ92729 1446 aa28.63■■■□□ 2.17
ACTB-210ENST00000477812 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ACTB-210ENST00000477812 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.6■■■□□ 2.17
ACTB-210ENST00000477812 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ACTB-210ENST00000477812 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.59■■■□□ 2.17
ACTB-210ENST00000477812 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ACTB-210ENST00000477812 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.56■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.56■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.55■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.55■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 KCNA6P17658 529 aa28.55■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 TECPR2O15040 1411 aa28.54■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.52■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 ABCC11Q96J66 1382 aa28.51■■■□□ 2.16
ACTB-210ENST00000477812 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.51■■■□□ 2.15
ACTB-210ENST00000477812 CPS1P31327 1500 aa28.5■■■□□ 2.15
ACTB-210ENST00000477812 PTCH1Q13635 1447 aa28.5■■■□□ 2.15
ACTB-210ENST00000477812 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ACTB-210ENST00000477812 DLC1Q96QB1 1528 aa28.47■■■□□ 2.15
ACTB-210ENST00000477812 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.47■■■□□ 2.15
ACTB-210ENST00000477812 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.43■■■□□ 2.14
ACTB-210ENST00000477812 STK26Q9P289 416 aa28.43■■■□□ 2.14
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ACTB-210ENST00000477812 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.42■■■□□ 2.14
ACTB-210ENST00000477812 SIRT1Q96EB6 747 aa28.4■■■□□ 2.14
ACTB-210ENST00000477812 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.39■■■□□ 2.14
ACTB-210ENST00000477812 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.38■■■□□ 2.13
ACTB-210ENST00000477812 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
ACTB-210ENST00000477812 TMEM94Q12767 1356 aa28.37■■■□□ 2.13
ACTB-210ENST00000477812 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.37■■■□□ 2.13
ACTB-210ENST00000477812 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ACTB-210ENST00000477812 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.34■■■□□ 2.13
ACTB-210ENST00000477812 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
ACTB-210ENST00000477812 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.32■■■□□ 2.12
ACTB-210ENST00000477812 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ACTB-210ENST00000477812 PRAM1Q96QH2 718 aa28.32■■■□□ 2.12
ACTB-210ENST00000477812 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.3■■■□□ 2.12
ACTB-210ENST00000477812 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
ACTB-210ENST00000477812 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.29■■■□□ 2.12
ACTB-210ENST00000477812 USP47Q96K76 1375 aa28.28■■■□□ 2.12
ACTB-210ENST00000477812 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
ACTB-210ENST00000477812 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.27■■■□□ 2.12
ACTB-210ENST00000477812 ADGRB2O60241 1585 aa28.25■■■□□ 2.11
ACTB-210ENST00000477812 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.25■■■□□ 2.11
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