RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 E9PCH4 1651 aa33.38■■■□□ 2.93
RBMS1-211ENST00000477486 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
RBMS1-211ENST00000477486 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.37■■■□□ 2.93
RBMS1-211ENST00000477486 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.36■■■□□ 2.93
RBMS1-211ENST00000477486 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP33.34■■■□□ 2.93
RBMS1-211ENST00000477486 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.34■■■□□ 2.93
RBMS1-211ENST00000477486 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
RBMS1-211ENST00000477486 ALKQ9UM73 1620 aa33.31■■■□□ 2.92
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.31■■■□□ 2.92
RBMS1-211ENST00000477486 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
RBMS1-211ENST00000477486 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM94Q12767 1356 aa33.3■■■□□ 2.92
RBMS1-211ENST00000477486 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa33.29■■■□□ 2.92
RBMS1-211ENST00000477486 ZFYVE9O95405 1425 aa33.28■■■□□ 2.92
RBMS1-211ENST00000477486 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
RBMS1-211ENST00000477486 TBX22Q9Y458 520 aa33.22■■■□□ 2.91
RBMS1-211ENST00000477486 TRIM52Q96A61 297 aa33.21■■■□□ 2.91
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
RBMS1-211ENST00000477486 NAIPQ13075 1403 aa33.17■■■□□ 2.9
RBMS1-211ENST00000477486 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
RBMS1-211ENST00000477486 SOCS7O14512 581 aa33.16■■■□□ 2.9
RBMS1-211ENST00000477486 MSH6P52701 1360 aa33.14■■■□□ 2.9
RBMS1-211ENST00000477486 C14orf37Q86TY3 774 aa33.14■■■□□ 2.9
RBMS1-211ENST00000477486 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
RBMS1-211ENST00000477486 NWD1Q149M9 1564 aa33.13■■■□□ 2.89
RBMS1-211ENST00000477486 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
RBMS1-211ENST00000477486 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.12■■■□□ 2.89
RBMS1-211ENST00000477486 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
RBMS1-211ENST00000477486 FAM135BQ49AJ0 1406 aa33.09■■■□□ 2.89
RBMS1-211ENST00000477486 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa33.07■■■□□ 2.88
RBMS1-211ENST00000477486 SLAIN2Q9P270 581 aa33.06■■■□□ 2.88
RBMS1-211ENST00000477486 HFM1A2PYH4 1435 aa33.04■■■□□ 2.88
RBMS1-211ENST00000477486 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
RBMS1-211ENST00000477486 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa33.03■■■□□ 2.88
RBMS1-211ENST00000477486 DIP2AQ14689 1571 aa33.02■■■□□ 2.88
RBMS1-211ENST00000477486 PIK3R4Q99570 1358 aa33.02■■■□□ 2.88
RBMS1-211ENST00000477486 TRPM2O94759 1503 aa32.99■■■□□ 2.87
RBMS1-211ENST00000477486 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.98■■■□□ 2.87
RBMS1-211ENST00000477486 CLTCL1P53675 1640 aa32.96■■■□□ 2.87
RBMS1-211ENST00000477486 ATF3P18847 181 aa32.96■■■□□ 2.87
RBMS1-211ENST00000477486 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.96■■■□□ 2.87
RBMS1-211ENST00000477486 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.95■■■□□ 2.87
RBMS1-211ENST00000477486 KIF1BO60333 1816 aa32.93■■■□□ 2.86
RBMS1-211ENST00000477486 CADPS2Q86UW7 1296 aa32.93■■■□□ 2.86
RBMS1-211ENST00000477486 PTPRUQ92729 1446 aa32.9■■■□□ 2.86
RBMS1-211ENST00000477486 VGFO15240 615 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
RBMS1-211ENST00000477486 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa32.87■■■□□ 2.85
RBMS1-211ENST00000477486 FOXD1Q16676 465 aa32.87■■■□□ 2.85
RBMS1-211ENST00000477486 METP08581 1390 aa32.85■■■□□ 2.85
RBMS1-211ENST00000477486 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa32.84■■■□□ 2.85
RBMS1-211ENST00000477486 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa32.84■■■□□ 2.85
RBMS1-211ENST00000477486 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
RBMS1-211ENST00000477486 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa32.81■■■□□ 2.84
RBMS1-211ENST00000477486 PHLPP1O60346 1717 aa32.81■■■□□ 2.84
RBMS1-211ENST00000477486 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.78■■■□□ 2.84
RBMS1-211ENST00000477486 JCADQ9P266 1359 aa32.75■■■□□ 2.83
RBMS1-211ENST00000477486 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
RBMS1-211ENST00000477486 RGL3Q3MIN7 710 aa32.73■■■□□ 2.83
RBMS1-211ENST00000477486 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
RBMS1-211ENST00000477486 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.71■■■□□ 2.83
RBMS1-211ENST00000477486 BRINP3Q76B58 766 aa32.7■■■□□ 2.83
RBMS1-211ENST00000477486 DCCP43146 1447 aa32.68■■■□□ 2.82
RBMS1-211ENST00000477486 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
RBMS1-211ENST00000477486 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
RBMS1-211ENST00000477486 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.64■■■□□ 2.82
RBMS1-211ENST00000477486 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
RBMS1-211ENST00000477486 PPLO60437 1756 aa32.63■■■□□ 2.81
RBMS1-211ENST00000477486 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa32.62■■■□□ 2.81
RBMS1-211ENST00000477486 MST1RQ04912 1400 aa32.6■■■□□ 2.81
RBMS1-211ENST00000477486 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa32.6■■■□□ 2.81
RBMS1-211ENST00000477486 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
RBMS1-211ENST00000477486 POTEAQ6S8J7 498 aa32.59■■■□□ 2.81
RBMS1-211ENST00000477486 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32.58■■■□□ 2.81
RBMS1-211ENST00000477486 ROBO2Q9HCK4 1378 aa32.58■■■□□ 2.81
RBMS1-211ENST00000477486 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa32.56■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.55■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 PTCH1Q13635 1447 aa32.54■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 STK26Q9P289 416 aa32.54■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 NALCNQ8IZF0 1738 aa32.54■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.52■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
RBMS1-211ENST00000477486 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.5■■■□□ 2.79
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM132EQ6IEE7 984 aa32.47■■■□□ 2.79
RBMS1-211ENST00000477486 C1orf167Q5SNV9 1468 aa32.47■■■□□ 2.79
RBMS1-211ENST00000477486 SHPRHQ149N8 1683 aa32.46■■■□□ 2.79
RBMS1-211ENST00000477486 LRP6O75581 1613 aa32.45■■■□□ 2.79
RBMS1-211ENST00000477486 ORAI2Q96SN7 254 aa32.45■■■□□ 2.79
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
RBMS1-211ENST00000477486 NHSL1Q5SYE7 1610 aa32.42■■■□□ 2.78
RBMS1-211ENST00000477486 WAPLQ7Z5K2 1190 aa32.42■■■□□ 2.78
RBMS1-211ENST00000477486 PRAG1Q86YV5 1406 aa32.41■■■□□ 2.78
RBMS1-211ENST00000477486 IFT172Q9UG01 1749 aa32.4■■■□□ 2.78
RBMS1-211ENST00000477486 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
RBMS1-211ENST00000477486 ESCO1Q5FWF5 840 aa32.38■■■□□ 2.77
RBMS1-211ENST00000477486 PIK3C2GO75747 1445 aa32.36■■■□□ 2.77
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