RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476541.1

CIZ1-217, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CIZ1, Length 513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1-217ENST00000476541 ZFYVE9O95405 1425 aa27.24■■□□□ 1.95
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CIZ1-217ENST00000476541 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.23■■□□□ 1.95
CIZ1-217ENST00000476541 EID1Q9Y6B2 187 aa27.23■■□□□ 1.95
CIZ1-217ENST00000476541 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CIZ1-217ENST00000476541 NEUROD1Q13562 356 aa27.21■■□□□ 1.95
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CIZ1-217ENST00000476541 RGL3Q3MIN7 710 aa27.2■■□□□ 1.94
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CIZ1-217ENST00000476541 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.18■■□□□ 1.94
CIZ1-217ENST00000476541 TONSLQ96HA7 1378 aa27.18■■□□□ 1.94
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CIZ1-217ENST00000476541 STRCQ7RTU9 1775 aa27.15■■□□□ 1.94
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CIZ1-217ENST00000476541 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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CIZ1-217ENST00000476541 ABCC11Q96J66 1382 aa26.73■■□□□ 1.87
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CIZ1-217ENST00000476541 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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CIZ1-217ENST00000476541 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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CIZ1-217ENST00000476541 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.65■■□□□ 1.86
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CIZ1-217ENST00000476541 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.57■■□□□ 1.84
CIZ1-217ENST00000476541 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.56■■□□□ 1.84
CIZ1-217ENST00000476541 USP47Q96K76 1375 aa26.55■■□□□ 1.84
CIZ1-217ENST00000476541 PRAM1Q96QH2 718 aa26.54■■□□□ 1.84
CIZ1-217ENST00000476541 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CIZ1-217ENST00000476541 TMEM94Q12767 1356 aa26.54■■□□□ 1.84
CIZ1-217ENST00000476541 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.53■■□□□ 1.84
CIZ1-217ENST00000476541 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.53■■□□□ 1.84
CIZ1-217ENST00000476541 ADGRB2O60241 1585 aa26.53■■□□□ 1.84
CIZ1-217ENST00000476541 SLC24A1O60721 1099 aa26.51■■□□□ 1.83
CIZ1-217ENST00000476541 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
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