RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 GSE1Q14687 1217 aa13.54□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 MYOM1P52179 1685 aa13.53□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 FAM161AQ3B820 660 aa13.53□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.53□□□□□ -0.24
LINC00886-201ENST00000472943 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.51□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 GOLGA2Q08379 1002 aa13.51□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.51□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.5□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 ERCC6Q03468 1493 aa13.5□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.5□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 PIK3C2GO75747 1445 aa13.49□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 SLFN5Q08AF3 891 aa13.49□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.49□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 CEP152O94986 1710 aa13.48□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 ABCC2Q92887 1545 aa13.48□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
LINC00886-201ENST00000472943 RGS3P49796 1198 aa13.46□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.44□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.44□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 TRPM2O94759 1503 aa13.44□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.44□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 BCAR3O75815 825 aa13.42□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 CDCA8Q53HL2 280 aa13.42□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 CLTCL1P53675 1640 aa13.42□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.42□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 APAF1O14727 1248 aa13.41□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 USP19O94966 1318 aa13.41□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 IGHDP01880 384 aa13.4□□□□□ -0.26
LINC00886-201ENST00000472943 E9PSI1 815 aa13.39□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.39□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 ABCC1P33527 1531 aa13.39□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 PTPRTO14522 1441 aa13.38□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 DEPDC5O75140 1603 aa13.38□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 SHROOM2Q13796 1616 aa13.38□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 NLRP1Q9C000 1473 aa13.37□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 CHD1O14646 1710 aa13.37□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.36□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 PLCH2O75038 1416 aa13.36□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 TET3O43151 1660 aa13.36□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 ERVK-7P63135 1459 aa13.36□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 SHPRHQ149N8 1683 aa13.36□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.36□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 PDE3AQ14432 1141 aa13.36□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 STAC3Q96MF2 364 aa13.36□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 SEC24BO95487 1268 aa13.35□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.35□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 ABCA6Q8N139 1617 aa13.34□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.34□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 NGEFQ8N5V2 710 aa13.34□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.34□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.33□□□□□ -0.27
LINC00886-201ENST00000472943 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.33□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.33□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.33□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.33□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 PANK1Q8TE04 598 aa13.33□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 IFT172Q9UG01 1749 aa13.32□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 COG6Q9Y2V7 657 aa13.32□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 WWC1Q8IX03 1113 aa13.32□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.32□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.31□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.3□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 KIF1BO60333 1816 aa13.3□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 MYOM2P54296 1465 aa13.3□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.29□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 CANXP27824 592 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 POGKQ9P215 609 aa13.29□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.29□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 BECN1Q14457 450 aa13.29□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.28□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.28□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.28□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.28□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 MROH2AA6NES4 1674 aa13.28□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
LINC00886-201ENST00000472943 ZMYM3Q14202 1370 aa13.27□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 RARSP54136 660 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa13.26□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
LINC00886-201ENST00000472943 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms