RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 ZMYM3Q14202 1370 aa22.89■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 CCDC7Q96M83 1385 aa22.88■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.88■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.88■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.87■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.87■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.85■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 PPLO60437 1756 aa22.84■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.84■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
USP20-204ENST00000472108 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.82■■□□□ 1.24
USP20-204ENST00000472108 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
USP20-204ENST00000472108 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.8■■□□□ 1.24
USP20-204ENST00000472108 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.79■■□□□ 1.24
USP20-204ENST00000472108 PIK3C2GO75747 1445 aa22.78■■□□□ 1.24
USP20-204ENST00000472108 ZFYVE9O95405 1425 aa22.77■■□□□ 1.24
USP20-204ENST00000472108 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP20-204ENST00000472108 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.75■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.75■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 IQGAP1P46940 1657 aa22.74■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 TESK2Q96S53 571 aa22.73■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 TNRQ92752 1358 aa22.72■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.72■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.71■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 ANP32CO43423 234 aa22.71■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
USP20-204ENST00000472108 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
USP20-204ENST00000472108 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.67■■□□□ 1.22
USP20-204ENST00000472108 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.67■■□□□ 1.22
USP20-204ENST00000472108 TMF1P82094 1093 aa22.66■■□□□ 1.22
USP20-204ENST00000472108 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
USP20-204ENST00000472108 ADGRB1O14514 1584 aa22.66■■□□□ 1.22
USP20-204ENST00000472108 C3P01024 1663 aa22.63■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 SLC24A1O60721 1099 aa22.63■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.63■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.63■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.62■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 NLRP1Q9C000 1473 aa22.62■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 CCER2I3L3R5 266 aa22.59■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.58■■□□□ 1.21
USP20-204ENST00000472108 CDCA8Q53HL2 280 aa22.57■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.57■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.57■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.55■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.54■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 ALKQ9UM73 1620 aa22.54■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.52■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.52■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.52■■□□□ 1.2
USP20-204ENST00000472108 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
USP20-204ENST00000472108 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
USP20-204ENST00000472108 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
USP20-204ENST00000472108 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
USP20-204ENST00000472108 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
USP20-204ENST00000472108 STK26Q9P289 416 aa22.46■■□□□ 1.19
USP20-204ENST00000472108 PTPRMP28827 1452 aa22.46■■□□□ 1.19
USP20-204ENST00000472108 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
USP20-204ENST00000472108 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
USP20-204ENST00000472108 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.45■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.45■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.45■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 PANK3Q9H999 370 aa22.44■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 SLIT1O75093 1534 aa22.44■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 LTKP29376 864 aa22.43■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.43■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.43■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 EID1Q9Y6B2 187 aa22.42■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.41■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 ABCC11Q96J66 1382 aa22.4■■□□□ 1.18
USP20-204ENST00000472108 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 BCANQ96GW7 911 aa22.38■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 PRAM1Q96QH2 718 aa22.38■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 DLC1Q96QB1 1528 aa22.38■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 METP08581 1390 aa22.38■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 EVC2Q86UK5 1308 aa22.38■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 POGKQ9P215 609 aa22.38■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.37■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 MYOM1P52179 1685 aa22.36■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 RALBP1Q15311 655 aa22.36■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 SIRT1Q96EB6 747 aa22.34■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.33■■□□□ 1.17
USP20-204ENST00000472108 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 MED14O60244 1454 aa22.33■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 CCDC184Q52MB2 194 aa22.32■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.32■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 TECPR2O15040 1411 aa22.3■■□□□ 1.16
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