RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465708.5

GLIS3-207, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 1,481 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-207ENST00000465708 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
GLIS3-207ENST00000465708 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
GLIS3-207ENST00000465708 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.25■■■□□ 2.11
GLIS3-207ENST00000465708 RGL3Q3MIN7 710 aa28.24■■■□□ 2.11
GLIS3-207ENST00000465708 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.24■■■□□ 2.11
GLIS3-207ENST00000465708 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.23■■■□□ 2.11
GLIS3-207ENST00000465708 LTKP29376 864 aa28.22■■■□□ 2.11
GLIS3-207ENST00000465708 MED14O60244 1454 aa28.21■■■□□ 2.11
GLIS3-207ENST00000465708 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
GLIS3-207ENST00000465708 STRCQ7RTU9 1775 aa28.2■■■□□ 2.11
GLIS3-207ENST00000465708 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.2■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 NEUROD1Q13562 356 aa28.2■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 STAC3Q96MF2 364 aa28.19■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.18■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 PPLO60437 1756 aa28.17■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.16■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 IFT172Q9UG01 1749 aa28.15■■■□□ 2.1
GLIS3-207ENST00000465708 MYOM2P54296 1465 aa28.12■■■□□ 2.09
GLIS3-207ENST00000465708 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
GLIS3-207ENST00000465708 IQGAP1P46940 1657 aa28.1■■■□□ 2.09
GLIS3-207ENST00000465708 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.09■■■□□ 2.09
GLIS3-207ENST00000465708 TONSLQ96HA7 1378 aa28.09■■■□□ 2.09
GLIS3-207ENST00000465708 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.08■■■□□ 2.09
GLIS3-207ENST00000465708 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.08■■■□□ 2.09
GLIS3-207ENST00000465708 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.07■■■□□ 2.08
GLIS3-207ENST00000465708 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.06■■■□□ 2.08
GLIS3-207ENST00000465708 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.06■■■□□ 2.08
GLIS3-207ENST00000465708 BCANQ96GW7 911 aa28.05■■■□□ 2.08
GLIS3-207ENST00000465708 PIK3C2GO75747 1445 aa28.03■■■□□ 2.08
GLIS3-207ENST00000465708 DIP2AQ14689 1571 aa28.03■■■□□ 2.08
GLIS3-207ENST00000465708 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.02■■■□□ 2.08
GLIS3-207ENST00000465708 TBX22Q9Y458 520 aa28.02■■■□□ 2.08
GLIS3-207ENST00000465708 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.01■■■□□ 2.07
GLIS3-207ENST00000465708 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28■■■□□ 2.07
GLIS3-207ENST00000465708 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.98■■■□□ 2.07
GLIS3-207ENST00000465708 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.95■■■□□ 2.07
GLIS3-207ENST00000465708 PIK3R4Q99570 1358 aa27.95■■■□□ 2.06
GLIS3-207ENST00000465708 ALKQ9UM73 1620 aa27.95■■■□□ 2.06
GLIS3-207ENST00000465708 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
GLIS3-207ENST00000465708 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
GLIS3-207ENST00000465708 LAMC1P11047 1609 aa27.94■■■□□ 2.06
GLIS3-207ENST00000465708 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
GLIS3-207ENST00000465708 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.88■■■□□ 2.05
GLIS3-207ENST00000465708 METP08581 1390 aa27.87■■■□□ 2.05
GLIS3-207ENST00000465708 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.87■■■□□ 2.05
GLIS3-207ENST00000465708 KCNA6P17658 529 aa27.85■■■□□ 2.05
GLIS3-207ENST00000465708 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
GLIS3-207ENST00000465708 NWD1Q149M9 1564 aa27.82■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.81■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 PTPRUQ92729 1446 aa27.8■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.8■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 ADGRB1O14514 1584 aa27.79■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.79■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.79■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 CPS1P31327 1500 aa27.78■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.77■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
GLIS3-207ENST00000465708 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.75■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.75■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 ABCC11Q96J66 1382 aa27.75■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 TECPR2O15040 1411 aa27.74■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.74■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.73■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 PTCH1Q13635 1447 aa27.73■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.73■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.7■■■□□ 2.03
GLIS3-207ENST00000465708 SIRT1Q96EB6 747 aa27.7■■■□□ 2.02
GLIS3-207ENST00000465708 STK26Q9P289 416 aa27.69■■■□□ 2.02
GLIS3-207ENST00000465708 DLC1Q96QB1 1528 aa27.68■■■□□ 2.02
GLIS3-207ENST00000465708 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
GLIS3-207ENST00000465708 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.67■■■□□ 2.02
GLIS3-207ENST00000465708 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.67■■■□□ 2.02
GLIS3-207ENST00000465708 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.67■■■□□ 2.02
GLIS3-207ENST00000465708 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.65■■■□□ 2.02
GLIS3-207ENST00000465708 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.64■■■□□ 2.01
GLIS3-207ENST00000465708 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.64■■■□□ 2.01
GLIS3-207ENST00000465708 TMEM94Q12767 1356 aa27.62■■■□□ 2.01
GLIS3-207ENST00000465708 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
GLIS3-207ENST00000465708 CERKQ8TCT0 537 aa27.61■■■□□ 2.01
GLIS3-207ENST00000465708 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.6■■■□□ 2.01
GLIS3-207ENST00000465708 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
GLIS3-207ENST00000465708 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 PRAM1Q96QH2 718 aa27.57■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 POGKQ9P215 609 aa27.57■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.56■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.53■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.53■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 C14orf37Q86TY3 774 aa27.52■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.52■■■□□ 2
GLIS3-207ENST00000465708 MSH6P52701 1360 aa27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms