RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CD109Q6YHK3 1445 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 IFT172Q9UG01 1749 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 CHADLQ6NUI6 762 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 MADDQ8WXG6 1647 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC7Q96M83 1385 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 IQGAP1P46940 1657 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 CCER2I3L3R5 266 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 REREQ9P2R6 1566 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3C2BO00750 1634 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 MROH2AA6NES4 1674 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 ABCC3O15438 1527 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 USP47Q96K76 1375 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRB3O60242 1522 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 OTUD5Q96G74 571 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 NRXN1Q9ULB1 1477 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 KIF7Q2M1P5 1343 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 KIF1BO60333 1816 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 MYOM2P54296 1465 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRC-210ENST00000462363 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 PRR29P0C7W0 189 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 POTEIP0CG38 1075 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 PPLO60437 1756 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 SYNMO15061 1565 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 NOS1P29475 1434 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 NPATQ14207 1427 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 AGLP35573 1532 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 KANK1Q14678 1352 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 KIF3BO15066 747 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 STAC3Q96MF2 364 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 MYOM1P52179 1685 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 TESK2Q96S53 571 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-210ENST00000462363 TSPOAP1O95153 1857 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRB1O14514 1584 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 ANP32CO43423 234 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRC-210ENST00000462363 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 RAPGEF3O95398 923 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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PTPRC-210ENST00000462363 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3C2GO75747 1445 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 ZFYVE9O95405 1425 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 RGL3Q3MIN7 710 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC184Q52MB2 194 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 ERVK-7P63135 1459 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-210ENST00000462363 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 PARD3Q8TEW0 1356 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 USP32Q8NFA0 1604 aa7.79□□□□□ -1.16
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