RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458696.2

LATS1-204, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 3

Gene LATS1, Length 602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-204ENST00000458696 TMEM94Q12767 1356 aa23.17■■□□□ 1.3
LATS1-204ENST00000458696 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
LATS1-204ENST00000458696 ZFYVE9O95405 1425 aa23.15■■□□□ 1.3
LATS1-204ENST00000458696 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.15■■□□□ 1.3
LATS1-204ENST00000458696 UNC13BO14795 1591 aa23.14■■□□□ 1.3
LATS1-204ENST00000458696 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.12■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.09■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 TBX22Q9Y458 520 aa23.09■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 E9PCH4 1651 aa23.09■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.09■■□□□ 1.29
LATS1-204ENST00000458696 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.07■■□□□ 1.28
LATS1-204ENST00000458696 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.07■■□□□ 1.28
LATS1-204ENST00000458696 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.07■■□□□ 1.28
LATS1-204ENST00000458696 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LATS1-204ENST00000458696 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
LATS1-204ENST00000458696 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.01■■□□□ 1.27
LATS1-204ENST00000458696 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LATS1-204ENST00000458696 SLAIN2Q9P270 581 aa23.01■■□□□ 1.27
LATS1-204ENST00000458696 NWD1Q149M9 1564 aa23.01■■□□□ 1.27
LATS1-204ENST00000458696 MSH6P52701 1360 aa22.99■■□□□ 1.27
LATS1-204ENST00000458696 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LATS1-204ENST00000458696 NAIPQ13075 1403 aa22.96■■□□□ 1.27
LATS1-204ENST00000458696 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.95■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 C14orf37Q86TY3 774 aa22.93■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 PIK3R4Q99570 1358 aa22.92■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 TRIM52Q96A61 297 aa22.92■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 PTPRUQ92729 1446 aa22.91■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.91■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.9■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.9■■□□□ 1.26
LATS1-204ENST00000458696 DIP2AQ14689 1571 aa22.86■■□□□ 1.25
LATS1-204ENST00000458696 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.86■■□□□ 1.25
LATS1-204ENST00000458696 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.85■■□□□ 1.25
LATS1-204ENST00000458696 ATF3P18847 181 aa22.85■■□□□ 1.25
LATS1-204ENST00000458696 HFM1A2PYH4 1435 aa22.84■■□□□ 1.25
LATS1-204ENST00000458696 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LATS1-204ENST00000458696 METP08581 1390 aa22.84■■□□□ 1.25
LATS1-204ENST00000458696 TRPM2O94759 1503 aa22.83■■□□□ 1.25
LATS1-204ENST00000458696 CLTCL1P53675 1640 aa22.81■■□□□ 1.24
LATS1-204ENST00000458696 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.8■■□□□ 1.24
LATS1-204ENST00000458696 POTEAQ6S8J7 498 aa22.8■■□□□ 1.24
LATS1-204ENST00000458696 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.79■■□□□ 1.24
LATS1-204ENST00000458696 JCADQ9P266 1359 aa22.78■■□□□ 1.24
LATS1-204ENST00000458696 FOXD1Q16676 465 aa22.78■■□□□ 1.24
LATS1-204ENST00000458696 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
LATS1-204ENST00000458696 BRINP3Q76B58 766 aa22.77■■□□□ 1.24
LATS1-204ENST00000458696 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.77■■□□□ 1.24
LATS1-204ENST00000458696 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
LATS1-204ENST00000458696 PHLPP1O60346 1717 aa22.75■■□□□ 1.23
LATS1-204ENST00000458696 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.73■■□□□ 1.23
LATS1-204ENST00000458696 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
LATS1-204ENST00000458696 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 DCCP43146 1447 aa22.69■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.69■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 KIF1BO60333 1816 aa22.68■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 MST1RQ04912 1400 aa22.67■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.67■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 RGL3Q3MIN7 710 aa22.66■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.65■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.64■■□□□ 1.22
LATS1-204ENST00000458696 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.63■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 LRP6O75581 1613 aa22.63■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.61■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.58■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 ORAI2Q96SN7 254 aa22.58■■□□□ 1.21
LATS1-204ENST00000458696 PTCH1Q13635 1447 aa22.57■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.57■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.57■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.57■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 STK26Q9P289 416 aa22.55■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.54■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 PPLO60437 1756 aa22.54■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 SHPRHQ149N8 1683 aa22.53■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.53■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.53■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.53■■□□□ 1.2
LATS1-204ENST00000458696 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.51■■□□□ 1.19
LATS1-204ENST00000458696 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.5■■□□□ 1.19
LATS1-204ENST00000458696 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.49■■□□□ 1.19
LATS1-204ENST00000458696 AFF2P51816 1311 aa22.48■■□□□ 1.19
LATS1-204ENST00000458696 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
LATS1-204ENST00000458696 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LATS1-204ENST00000458696 RXRBP28702 533 aa22.47■■□□□ 1.19
LATS1-204ENST00000458696 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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