RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 COG3Q96JB2 828 aa12.45□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 NCOA2Q15596 1464 aa12.45□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.45□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 MIA2Q96PC5 1412 aa12.45□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 GORABQ5T7V8 394 aa12.45□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa12.45□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 HMMRO75330 724 aa12.44□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 AFAP1Q8N556 730 aa12.44□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 NGEFQ8N5V2 710 aa12.44□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12.44□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 CHMP5Q9NZZ3 219 aa12.43□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.43□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 E9PSI1 815 aa12.42□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 APAF1O14727 1248 aa12.42□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 NBPF8Q3BBV2 869 aa12.42□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 PKNOX2Q96KN3 472 aa12.42□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 NAIPQ13075 1403 aa12.42□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 MRE11P49959 708 aa12.42□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.41□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 GRIN2AQ12879 1464 aa12.41□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 NCOA1Q15788 1441 aa12.41□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 PRDM2Q13029 1718 aa12.4□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 AAMPQ13685 434 aa12.4□□□□□ -0.42
TNS1-209ENST00000446688 TEFQ10587 303 aa12.39□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 CDCA7LQ96GN5 454 aa12.39□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 IQGAP2Q13576 1575 aa12.39□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.38□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 TMEM132EQ6IEE7 984 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 NRDCO43847 1150 aa12.37□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 RRP9O43818 475 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 GPATCH3Q96I76 525 aa12.36□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 EVA1CP58658 441 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 PSME1Q06323 249 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 COG6Q9Y2V7 657 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 TPM2P07951 284 aa12.35□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 STAC3Q96MF2 364 aa12.34□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 WDR62O43379 1518 aa12.34□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.34□□□□□ -0.43
TNS1-209ENST00000446688 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 MAP7D2Q96T17 732 aa12.33□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.33□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa12.33□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 TRAK2O60296 914 aa12.33□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.33□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 CFAP70Q5T0N1 1121 aa12.32□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 RIPK4P57078 832 aa12.32□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD45Q5TZF3 282 aa12.31□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 PDE3AQ14432 1141 aa12.31□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 NECTIN2Q92692 538 aa12.31□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12.31□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 C22orf23Q9BZE7 217 aa12.3□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 CABP2Q9NPB3 220 aa12.3□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 HECW1Q76N89 1606 aa12.3□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa12.29□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.29□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 TOMM22Q9NS69 142 aa12.29□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 HMOX1P09601 288 aa12.29□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 DRC7Q8IY82 874 aa12.29□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.29□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.29□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa12.28□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 G3V3G9 751 aa12.28□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.28□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.28□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.28□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 RILPL2Q969X0 211 aa12.28□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.27□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 NLRP6P59044 892 aa12.27□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
TNS1-209ENST00000446688 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.27□□□□□ -0.45
TNS1-209ENST00000446688 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
TNS1-209ENST00000446688 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
TNS1-209ENST00000446688 MCM4P33991 863 aa12.27□□□□□ -0.45
TNS1-209ENST00000446688 ESPNB1AK53 854 aa12.26□□□□□ -0.45
TNS1-209ENST00000446688 ATF3P18847 181 aa12.26□□□□□ -0.45
TNS1-209ENST00000446688 NBPF1Q3BBV0 1214 aa12.26□□□□□ -0.45
TNS1-209ENST00000446688 RUNDC1Q96C34 613 aa12.26□□□□□ -0.45
TNS1-209ENST00000446688 ROCK1Q13464 1354 aa12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms