RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431381.5

CITED1-206, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CITED1, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-206ENST00000431381 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.54■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 PTPRMP28827 1452 aa18.53■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa18.53■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.53■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.52■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.52■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.52■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CITED1-206ENST00000431381 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.51■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 BCANQ96GW7 911 aa18.48■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 EID1Q9Y6B2 187 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 ZFYVE9O95405 1425 aa18.46■□□□□ 0.55
CITED1-206ENST00000431381 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.46■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.45■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 PIK3C2GO75747 1445 aa18.45■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 USP47Q96K76 1375 aa18.44■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 LAMC1P11047 1609 aa18.42■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa18.42■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.42■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.41■□□□□ 0.54
CITED1-206ENST00000431381 SLIT1O75093 1534 aa18.38■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.38■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.36■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.36■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 ALKQ9UM73 1620 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 LTKP29376 864 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 IQGAP1P46940 1657 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED1-206ENST00000431381 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.32■□□□□ 0.52
CITED1-206ENST00000431381 STK26Q9P289 416 aa18.31■□□□□ 0.52
CITED1-206ENST00000431381 ADGRB1O14514 1584 aa18.3■□□□□ 0.52
CITED1-206ENST00000431381 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.3■□□□□ 0.52
CITED1-206ENST00000431381 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa18.29■□□□□ 0.52
CITED1-206ENST00000431381 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.28■□□□□ 0.52
CITED1-206ENST00000431381 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa18.27■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 TMF1P82094 1093 aa18.26■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 SLC24A1O60721 1099 aa18.25■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 POGKQ9P215 609 aa18.25■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 DIP2AQ14689 1571 aa18.25■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.24■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.23■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 METP08581 1390 aa18.23■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 TBX22Q9Y458 520 aa18.23■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.22■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 CCDC7Q96M83 1385 aa18.22■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.22■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 HSPA2P54652 639 aa18.21■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.21■□□□□ 0.51
CITED1-206ENST00000431381 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 CDCA8Q53HL2 280 aa18.2■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 PRAM1Q96QH2 718 aa18.2■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 TESK2Q96S53 571 aa18.2■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 MED14O60244 1454 aa18.19■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.19■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 ABCC11Q96J66 1382 aa18.18■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.18■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 DLC1Q96QB1 1528 aa18.18■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.17■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.16■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 PIK3R4Q99570 1358 aa18.15■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa18.15■□□□□ 0.5
CITED1-206ENST00000431381 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.14■□□□□ 0.49
CITED1-206ENST00000431381 EVC2Q86UK5 1308 aa18.14■□□□□ 0.49
CITED1-206ENST00000431381 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CITED1-206ENST00000431381 CPS1P31327 1500 aa18.13■□□□□ 0.49
CITED1-206ENST00000431381 TECPR2O15040 1411 aa18.13■□□□□ 0.49
CITED1-206ENST00000431381 SIRT1Q96EB6 747 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED1-206ENST00000431381 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED1-206ENST00000431381 PTPRUQ92729 1446 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms