RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430356.3

PITRM1-AS1-201, PITRM1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PITRM1-AS1, Length 3,998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RALBP1Q15311 655 aa11.01□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.01□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.01□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PDE3BQ13370 1112 aa11.01□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.01□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CEP152O94986 1710 aa11□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIF15Q9NS87 1388 aa11□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 USP32Q8NFA0 1604 aa11□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM69CQ0P6D2 419 aa10.99□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FANCAO15360 1455 aa10.99□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC141Q6ZP82 1450 aa10.99□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.99□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.99□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CD109Q6YHK3 1445 aa10.98□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PKD2Q13563 968 aa10.98□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.98□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM161AQ3B820 660 aa10.98□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NLRP13Q86W25 1043 aa10.98□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.97□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PARD3Q8TEW0 1356 aa10.96□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SHPRHQ149N8 1683 aa10.96□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCA6Q8N139 1617 aa10.96□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RAPGEF3O95398 923 aa10.96□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.96□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.96□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NUP155O75694 1391 aa10.95□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.95□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ADGRL1O94910 1474 aa10.95□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.95□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DEPDC5O75140 1603 aa10.94□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SYNMO15061 1565 aa10.94□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.94□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.94□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.93□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ABCC1P33527 1531 aa10.93□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 BECN1Q14457 450 aa10.93□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.91□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RGL3Q3MIN7 710 aa10.91□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 POGKQ9P215 609 aa10.9□□□□□ -0.66
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.9□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MADDQ8WXG6 1647 aa10.89□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.89□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KIF3BO15066 747 aa10.89□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PKNOX2Q96KN3 472 aa10.89□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TSPOAP1O95153 1857 aa10.88□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.88□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CLTCL1P53675 1640 aa10.87□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.87□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 C8orf34Q49A92 452 aa10.86□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZNF521Q96K83 1311 aa10.85□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 PANK3Q9H999 370 aa10.85□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GOLGA2Q08379 1002 aa10.84□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GGT6Q6P531 493 aa10.84□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.84□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa10.84□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.84□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.84□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.84□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ATP7AQ04656 1500 aa10.84□□□□□ -0.67
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 DIP2BQ9P265 1576 aa10.83□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.83□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.83□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.83□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ADGRB2O60241 1585 aa10.82□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.82□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 KLHL34Q8N239 644 aa10.82□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.81□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.81□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa10.81□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.81□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa10.8□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 REREQ9P2R6 1566 aa10.8□□□□□ -0.68
PITRM1-AS1-201ENST00000430356 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms