RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
VARS-216ENST00000428445 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
VARS-216ENST00000428445 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
VARS-216ENST00000428445 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.57■■□□□ 1.68
VARS-216ENST00000428445 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.56■■□□□ 1.68
VARS-216ENST00000428445 ZFYVE9O95405 1425 aa25.54■■□□□ 1.68
VARS-216ENST00000428445 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.54■■□□□ 1.68
VARS-216ENST00000428445 ITGAEP38570 1179 aa25.54■■□□□ 1.68
VARS-216ENST00000428445 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.54■■□□□ 1.68
VARS-216ENST00000428445 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
VARS-216ENST00000428445 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
VARS-216ENST00000428445 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.52■■□□□ 1.68
VARS-216ENST00000428445 NWD1Q149M9 1564 aa25.51■■□□□ 1.67
VARS-216ENST00000428445 E9PCH4 1651 aa25.5■■□□□ 1.67
VARS-216ENST00000428445 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.5■■□□□ 1.67
VARS-216ENST00000428445 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
VARS-216ENST00000428445 UNC13BO14795 1591 aa25.49■■□□□ 1.67
VARS-216ENST00000428445 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
VARS-216ENST00000428445 SLAIN2Q9P270 581 aa25.47■■□□□ 1.67
VARS-216ENST00000428445 MSH6P52701 1360 aa25.46■■□□□ 1.67
VARS-216ENST00000428445 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
VARS-216ENST00000428445 POTEAQ6S8J7 498 aa25.45■■□□□ 1.66
VARS-216ENST00000428445 TBX22Q9Y458 520 aa25.44■■□□□ 1.66
VARS-216ENST00000428445 NUP155O75694 1391 aa25.43■■□□□ 1.66
VARS-216ENST00000428445 ROCK1Q13464 1354 aa25.42■■□□□ 1.66
VARS-216ENST00000428445 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.41■■□□□ 1.66
VARS-216ENST00000428445 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
VARS-216ENST00000428445 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.4■■□□□ 1.66
VARS-216ENST00000428445 C14orf37Q86TY3 774 aa25.39■■□□□ 1.66
VARS-216ENST00000428445 PHLPP1O60346 1717 aa25.39■■□□□ 1.65
VARS-216ENST00000428445 PTPRUQ92729 1446 aa25.33■■□□□ 1.65
VARS-216ENST00000428445 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.33■■□□□ 1.65
VARS-216ENST00000428445 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
VARS-216ENST00000428445 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.29■■□□□ 1.64
VARS-216ENST00000428445 JCADQ9P266 1359 aa25.29■■□□□ 1.64
VARS-216ENST00000428445 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
VARS-216ENST00000428445 ATF3P18847 181 aa25.28■■□□□ 1.64
VARS-216ENST00000428445 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
VARS-216ENST00000428445 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.27■■□□□ 1.64
VARS-216ENST00000428445 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.26■■□□□ 1.63
VARS-216ENST00000428445 DIP2AQ14689 1571 aa25.26■■□□□ 1.63
VARS-216ENST00000428445 PIK3R4Q99570 1358 aa25.25■■□□□ 1.63
VARS-216ENST00000428445 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.24■■□□□ 1.63
VARS-216ENST00000428445 TRPM2O94759 1503 aa25.24■■□□□ 1.63
VARS-216ENST00000428445 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.23■■□□□ 1.63
VARS-216ENST00000428445 LRP6O75581 1613 aa25.22■■□□□ 1.63
VARS-216ENST00000428445 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
VARS-216ENST00000428445 METP08581 1390 aa25.2■■□□□ 1.63
VARS-216ENST00000428445 BRINP3Q76B58 766 aa25.2■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 CLTCL1P53675 1640 aa25.17■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.16■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.14■■□□□ 1.62
VARS-216ENST00000428445 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.12■■□□□ 1.61
VARS-216ENST00000428445 NAIPQ13075 1403 aa25.12■■□□□ 1.61
VARS-216ENST00000428445 SHPRHQ149N8 1683 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-216ENST00000428445 TRIM52Q96A61 297 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-216ENST00000428445 MST1RQ04912 1400 aa25.1■■□□□ 1.61
VARS-216ENST00000428445 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
VARS-216ENST00000428445 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.08■■□□□ 1.61
VARS-216ENST00000428445 KIF1BO60333 1816 aa25.07■■□□□ 1.6
VARS-216ENST00000428445 DCCP43146 1447 aa25.06■■□□□ 1.6
VARS-216ENST00000428445 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
VARS-216ENST00000428445 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.03■■□□□ 1.6
VARS-216ENST00000428445 FOXD1Q16676 465 aa25.02■■□□□ 1.6
VARS-216ENST00000428445 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.02■■□□□ 1.6
VARS-216ENST00000428445 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.01■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.01■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 AFF2P51816 1311 aa24.99■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.98■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 RXRBP28702 533 aa24.98■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 ORAI2Q96SN7 254 aa24.97■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 C8orf37Q96NL8 207 aa24.96■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.96■■□□□ 1.59
VARS-216ENST00000428445 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.94■■□□□ 1.58
VARS-216ENST00000428445 HFM1A2PYH4 1435 aa24.94■■□□□ 1.58
VARS-216ENST00000428445 ADAMTS2O95450 1211 aa24.92■■□□□ 1.58
VARS-216ENST00000428445 PPLO60437 1756 aa24.9■■□□□ 1.58
VARS-216ENST00000428445 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
VARS-216ENST00000428445 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.89■■□□□ 1.58
VARS-216ENST00000428445 PTCH1Q13635 1447 aa24.88■■□□□ 1.57
VARS-216ENST00000428445 RGL3Q3MIN7 710 aa24.88■■□□□ 1.57
VARS-216ENST00000428445 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.87■■□□□ 1.57
VARS-216ENST00000428445 NGLY1Q96IV0 654 aa24.86■■□□□ 1.57
VARS-216ENST00000428445 STK26Q9P289 416 aa24.85■■□□□ 1.57
VARS-216ENST00000428445 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
VARS-216ENST00000428445 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.83■■□□□ 1.57
VARS-216ENST00000428445 NUTM2FA1L443 756 aa24.82■■□□□ 1.56
VARS-216ENST00000428445 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
VARS-216ENST00000428445 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
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