RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.83□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.83□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AKNAQ7Z591 1439 aa7.83□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.83□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HFM1A2PYH4 1435 aa7.82□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOSBP53539 338 aa7.82□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYOM3Q5VTT5 1437 aa7.82□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MIA2Q96PC5 1412 aa7.82□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.82□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPREP23469 700 aa7.81□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PBRM1Q86U86 1689 aa7.81□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HECW1Q76N89 1606 aa7.81□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBPF3Q9H094 633 aa7.78□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NCOA2Q15596 1464 aa7.78□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAPKBP1O60336 1514 aa7.78□□□□□ -1.16
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GRIN2AQ12879 1464 aa7.77□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.77□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UACAQ9BZF9 1416 aa7.77□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SYNJ2O15056 1496 aa7.76□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ROCK1Q13464 1354 aa7.76□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 P3H3Q8IVL6 736 aa7.76□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUP160Q12769 1436 aa7.76□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DISP1Q96F81 1524 aa7.75□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BCAMP50895 628 aa7.75□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 JPH4Q96JJ6 628 aa7.75□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NAIPQ13075 1403 aa7.74□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERCC6Q03468 1493 aa7.74□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIAA0556O60303 1618 aa7.74□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.73□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PROX2Q3B8N5 592 aa7.73□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.73□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.73□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.71□□□□□ -1.17
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.71□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPRKQ15262 1439 aa7.7□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa7.7□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.7□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.7□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.69□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.69□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EVI5O60447 810 aa7.69□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.69□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.69□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.68□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL9A1P20849 921 aa7.68□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ITGAEP38570 1179 aa7.68□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCNC4Q03721 635 aa7.68□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LAPTM4AQ15012 233 aa7.68□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WBP1LQ9NX94 342 aa7.68□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7.67□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GFRA3O60609 400 aa7.66□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CEP170Q5SW79 1584 aa7.66□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.66□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADGRL2O95490 1459 aa7.65□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NEUROD1Q13562 356 aa7.65□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.65□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.65□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.65□□□□□ -1.18
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DAPK1P53355 1430 aa7.64□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TONSLQ96HA7 1378 aa7.64□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.64□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.64□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.64□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ABCA8O94911 1581 aa7.63□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.63□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ABCC5O15440 1437 aa7.63□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.62□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NCOA1Q15788 1441 aa7.61□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLEKHD1A6NEE1 506 aa7.61□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCER2I3L3R5 266 aa7.61□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.61□□□□□ -1.19
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms